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小分子化合物在重編程中的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1122 發(fā)布日期:2022-3-22  來源:MedChemExpress

   2006 年,日本科學(xué)家山中伸彌等人利用四個轉(zhuǎn)錄因子(Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc)將小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(MEFs)和成體成纖維細(xì)胞重編程為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(induced pluripotent stem cells, iPSCs)[1],iPSCs 和胚胎多能干細(xì)胞(embryonic stem cells, ESCs)一樣,具有自我更新的能力,在體外可以長期擴增,并能夠分化為三個胚層的組織和細(xì)胞。這一研究成果使得重編程的研究工作如火如荼。

       重編程(reprogramming )是指通過一定的手段使已經(jīng)分化的細(xì)胞回復(fù)到具有分化能力的干細(xì)胞的狀態(tài)。根據(jù)所用方法的不同,重編程可以分為轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)的重編程和非轉(zhuǎn)錄因子的重編程。非轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)的重編程常用的方法為小分子化合物。

       小分子化合物在重編程領(lǐng)域具有得天獨厚的優(yōu)勢。首先,小分子化合物避免了轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)重編程常用到的病毒載體整合進基因組,不會破壞細(xì)胞基因組的結(jié)果,安全性較高;其次,大部分小分子化合物均能以滲透的方式進入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮作用,省去了細(xì)胞轉(zhuǎn)染、病毒包裝、細(xì)胞感染等繁瑣步驟,且便于進行定量研究,可操作性強;此外,小分子化合物結(jié)構(gòu)多樣、靶點清晰、價格低廉、易于獲得且可選擇性大;最后,小分子化合物價格相對低廉,可節(jié)省大量成本。 

   圖1.分化和重編程的影響機制

    2011 年,中國科學(xué)家鄧宏魁等人發(fā)現(xiàn),化合物組合(VPA, CHIR99021, 616452, Tranylcypromine)可以成功替代 YAMANAKA 四因子(OSKM)中的三個轉(zhuǎn)錄因子(Sox2/Klf4/c-Myc),與 Oct4 一起作用將小鼠成纖維細(xì)胞重編程為多能干細(xì)胞[2]。接下來,通過 10000 個化合物的篩選,鄧宏魁團隊又發(fā)現(xiàn)了可以代替 Oct4 的化合物組合。從而實現(xiàn)了純化合物組合(VPA, CHIR99021, Repsox, Forskolin, Tranylcypromine, DZNep)介導(dǎo)的重編程,該研究成果于 2013 年發(fā)表在 Science上[3]。之后,利用小分子化合物誘導(dǎo)體細(xì)胞重編程又取得了很多新的進展,見表1。此外,除了將體細(xì)胞重編程為 iPSCs 之外,科學(xué)家們還發(fā)現(xiàn)小分子化合物還可以成功將一種體細(xì)胞誘導(dǎo)轉(zhuǎn)化為另一種體細(xì)胞,該過程叫做轉(zhuǎn)分化。目前,僅用小分子化合物成功實現(xiàn)轉(zhuǎn)分化的報道主要集中在神經(jīng)細(xì)胞、心肌細(xì)胞等領(lǐng)域 [8]

表1.小分子化合物介導(dǎo)重編程研究進展

     胚胎發(fā)育的過程涉及眾多基因的選擇性表達,多個信號通路的開關(guān),而重編程則是反其道而行之。目前,很多信號通路都已經(jīng)被研究得很透徹,小分子化合物可以通過靶向調(diào)節(jié)這些信號通路上的關(guān)鍵環(huán)節(jié),實現(xiàn)對細(xì)胞命運的控制。此外,小分子化合物可以直接作為藥物進行臨床開發(fā)。小分子化合物在重編程領(lǐng)域具有較好的應(yīng)用前景。
 

Reference

[1]Takahashi K, YamanakaS. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblastcultures by defined factors. Cell,2006,126(4):663-676.

[2] Tongxiang Lin,Shouhai Wu. Reprogrammingwith Small Molecules instead of Exogenous Transcription Factors.Stem Cells Int.2015; 2015: 794632.

[3] Yukimasa TYoshinori HToshikazu YPing D. Chemicalcompound-based direct reprogramming for future clinical applications. Biosci Rep. 2018 Jun29; 38(3): BSR20171650.

[4] Ye J, Ge J, Zhang X, et al. Pluripotent stem cells induced from mouse neural stem cells and small intestinal epithelial cells by small molecule compounds. Cell Research, 2015,26(1):34-45.

[5] Li D, Wang L, Hou J, et al. Optimized approaches for generation of integration-free iPSCs from human urine-derived cells with small molecules and autologous feeder. Stem Cell Reports, 2016,6(5):717-728. 

[6] Xiaoping Han H Y. A molecular roadmap for induced multi-lineage trans- differentiation of fibroblasts by chemical combinations. Cell Research, 2017:1-16.

[7] Han X, Yu H, Huang D, et al. A molecular roadmap forinduced multi-lineage trans- differentiation of fibroblasts by chemicalcombinations. Cell Research, 2017:1-16.

[8] Yukimasa TYoshinori HToshikazu Y, et al.Chemical compound-based direct reprogramming for future clinical applications.Biosci Rep. 2018 Jun 29; 38(3): BSR20171650.

 

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