經典脂質組學介紹
技術優勢
高分辨儀器平臺：Q Exactive Focus（Thermo Fisher Scientific）
內標：2個同位素內標
六大質控體系：過程質控、數據質控
專業的數據分析：專業數據處理和分析軟件，PCA、OPLS-DA、T-test等分析
項目經驗：平均項目可檢出900+脂質
定性結果更準確，適用性高：保留時間預測算法輔助定性
數據庫
基于LipidBlast構建包含甘油磷脂、鞘脂、固醇脂、甘油脂、脂肪酸、糖脂等在內的52類脂質，22W+種脂質。
技術參數
樣本要求
植物組織：200-500 mg/sample
動物及臨床組織標本：200 mg/sample
血清、血漿：200 µL/sample
微生物、細胞：1x107 cells/sample
生物學重復
樣本數量：植物和微生物n≥6，動物樣本n≥10，臨床樣本n≥30,所有重復樣本獨立分析。
其他種類的樣品在收集之前請聯系公司銷售工程師。
檢測平臺
高分辨儀器平臺：
Q Exactive Focus（Thermo Fisher Scientific）
常規項目周期
實驗檢測：30個自然日，含基礎數據分析
應用方向
1、樣本中脂質物質鑒定；
2、脂質功能及代謝調控研究；
3、脂質代謝途徑及網絡研究；
4、脂質生物標志物發掘。
案例分析
脂質組學和轉錄組學研究棉蚜蟲脂質變化機理
棉岈蟲 (Aphis gossyp ii Glo ver)是種重要的農業害蟲，是我國棉花主要害蟲之。它通過寄生吸食汁液，能夠在早期生長季節對棉花幼苗造成嚴重損害。據報道擬寄生物對岈蟲的脂質合成有影響，然而目前尚不清楚這些脂質變化如何影響棉岈蟲生理過程。本研究首次基于RNA-Seq與脂質組學聯合分析方法，探討了擬寄生物對棉岈蟲脂代謝及基因表達的影響。結果表明寄生導致脂質代謝的顯著變化及甘油酯和甘油磷脂的組成變化。這些數據可作為研究寄生蟲－昆蟲相互作用的寶貴資源，并將進一步表征脂質合成途徑及其與三羧酸(TCA)循環和糖酵解的關系。
圖2 寄生誘因與脂質代謝相關基因的表達參考文獻
Gao X K, Zhang S, Luo J Y, et al. Lipidomics and RNA-Seq Study of Lipid Regulation in Aphis gossypii parasitized by Lysiphlebia japonica[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1): 1364.
百趣協助客戶發表文獻
中國科學技術大學：Li Q, Wang Y, Wu S, et al. CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress.
Cell Metabolism 2019,30, 1-17.
課題方向：Circacc1 調節代謝應激下 AMPK 復合物的組裝和激活
復旦大學附屬腫瘤醫院：Yue Gong, Peng Ji, Yun-Song Yang, et al. Metabolic-Pathway-Based Subtyping of Triple Negative Breast Cancer Reveals Potential Therapeutic Targets.
Cell Metabolism 2020 November 06.
課題方向: 基于代謝途徑的三陰性乳腺癌亞型揭示了潛在的治療靶點
