發現代謝組學-親水版技術介紹與應用案例分析
「發現代謝組學-親水版」是代謝組學核心研究手段之一，可高效完成樣本中親水性代謝物的檢測定性，即通過液質聯用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數小分子代謝物的動態變化，重點尋找在實驗組和對照組中有顯著變化的代謝物，進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系，其研究對象大都是分子量1500Da以內的小分子物質。
技術優勢
• 較高的靈敏度、分辨率
• 較寬的動態范圍
• 適合于生物樣本中復雜代謝產物的檢測和潛在標志物的鑒定
• 適合對標本中未知代謝物的探索研究
• 定性準：6D質控體系
技術路線
技術參數
樣本要求
血清、血漿：200 μL/sample
尿液：1 mL/sample
組織：200 mg/sample
糞便、腸道內容物：200 mg/sample
細胞、微生物：1X 107 cells/sample
培養液：200 μL/sample
生物學重復
樣本數量：植物和微生物n≥6，動物樣本n≥10，臨床樣本n≥30，所有重復樣本獨立分析
其他種類的樣品在收集之前請聯系我司銷售工程師
檢測平臺
UHPLC-QE-MS(Thermo Vanquish UHPLC-Thermo Q Exactive HFX)
常規項目周期
17個自然日，含基礎數據分析
應用方向
• 表型和生理功能研究
• 疾病病理研究
• 臨床診斷及治療
• 藥物研究
• 中醫理論研究
• 食品科學與營養學研究
• 畜牧與農林業研究
• 環境毒理研究
案例分析
標題：IgG4相關性硬化性膽管炎和原發性硬化性膽管炎中糞便微生物組和代謝組的改變
研究對象: 硬化性膽管炎
期刊: Gut
影響因子: 23.059
時間: 2021年
研究背景
IgG4相關硬化性膽管炎(IgG4-SC)與原發性硬化性膽管炎(PSC)有多種臨床相似之處，但皮質類固醇治療對大多數 IgG4-SC 患者有效，而對 PSC 患者存在無效性，且兩種疾病的預后也不同，PSC發生肝硬化、 膽管癌和結直腸癌的風險高于IgG4-SC。這兩種硬化性膽管炎的發病機制目前尚不清楚。雖然在PSC中腸道菌群失調已被廣泛研究，但腸道菌群在IgG4-SC中的作用機制仍不清楚。
研究結果
IgG4-SC和PSC具有不同的宿主—微生物相互作用，可能參與疾病的發病機制。研究數據強調了 IgG4-SC的獨特性。在IgG4-SC患者中，差異菌群和代謝物與轉氨酶顯著相關。Blautia菌的顯著降低和琥 珀酸的顯著升高可能是IgG4-SC中肝臟炎癥的基礎。相比之下，在 PSC中，菌群和代謝特征的改變與膽汁淤積表型相關，尤其是Eubacterium和菌群代謝物（包括次級膽汁酸）在PSC中均顯著降低。而且，基于代謝物的預測模型在區分疾病狀態方面比基于菌群的預測模型更有效。
研究思路
結果展示
在IgG4-SC中唯一改變的27種代謝物中，大多數（n=23，85%）在疾病組增加。這些包括幾種潛在的促炎癥介質、二十二碳五烯酸、8,11,14-二十碳三烯、花生四烯酸、羥基異丙酸等。在PSC中鑒定出67種代謝物發生了變化。與IgG4-SC相比，大多數代謝物（n=49，73%）在疾病組表現出較低的水平。由腸道細菌代謝的次級膽汁酸，包括脫氧膽酸（DCA）、石膽酸（LCA）和甘氨酸結合石膽酸（GLCA），在 PSC中顯著減少。
