功能分類PCR芯片技術(shù)服務(wù)

    功能分類基因芯片是生物學(xué)通路研究的重要工具。這種芯片將微列陣技術(shù)與特定生物學(xué)通路（specific biological pathways）的最新知識有機(jī)結(jié)合, 可以大大縮短發(fā)現(xiàn)診治各種疾病的生物學(xué)標(biāo)志物(biomarkers)的時間。芯片上的基因包括了那些與研究對象有確定關(guān)系的基因，或至少是與研究對象的關(guān)系有待考證的基因。如果研究對象是某一生物學(xué)通路的基因，則使用針對該類基因的功能分類基因芯片比使用高密度表達(dá)譜芯片更加有效便利。
   美國SABiosciences公司（原SuperArray公司）設(shè)計了超過100種功能分類芯片，涵蓋生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域，在國際上處于領(lǐng)先地位。 其開發(fā)的第二代功能分類基因芯片（Real-time PCR芯片），可在一次實(shí)驗(yàn)中準(zhǔn)確檢測上百個基因的mRNA水平，并且將檢測精度提高到與實(shí)時定量PCR相當(dāng)?shù)乃�平。功能分類PCR芯片：靈敏度高，樣品的使用量低，每張芯片使用的總RNA最少可為0.5ng；可觀察到的動態(tài)線性范圍超過105，可以同時檢測表達(dá)量差異較大的基因；重復(fù)性高，Ct值的平均差異只有0.25個循環(huán)；分辨率高，可檢測超過兩倍的基因表達(dá)量變化；特異性好，PCR擴(kuò)增產(chǎn)物條帶單一。SABiosciences公司設(shè)計了超過100種功能分類PCR芯片，涵蓋生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域，詳情請見后頁列表。
    SABioscienses還提供芯片定制服務(wù)（Custom PCR Arrays）。定制PCR芯片是根據(jù)不同研究需要量身定做的PCR芯片。定制PCR芯片被廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)譜結(jié)果驗(yàn)證及特定信號通路的研究等。同時，它還特別適合于大樣本的生物學(xué)標(biāo)記物研究，無論這些生物學(xué)標(biāo)志物是來自于研究者的前期研究成果、各種文獻(xiàn)報道、還是表達(dá)譜芯片篩選的結(jié)果，SA Biosciences都能夠靈活設(shè)計出符合需要的定制PCR芯片，獲得高精確性、高靈敏度，高重復(fù)性的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，縮短生物學(xué)標(biāo)志物篩選的進(jìn)程。
 

SABioscienses功能分類PCR芯片優(yōu)點(diǎn)
※ 靈敏度高：樣品的使用量低，每張芯片使用的總RNA最少可為0.5ng；
※ 動態(tài)線性范圍超過105：可以同時檢測表達(dá)量差異較大的基因；
※ 重復(fù)性高：Ct值的平均差異只有0.25個循環(huán)；
※ 分辨率高：可檢測超過兩倍的基因表達(dá)量變化；
※ 特異性好：PCR擴(kuò)增產(chǎn)物條帶單一。
※ 數(shù)據(jù)全面、可靠：芯片包含的基因來自公共權(quán)威數(shù)據(jù)庫、權(quán)威綜述和相關(guān)文獻(xiàn)挖掘
※ 覆蓋度高：SABiosciences公司設(shè)計了超過200種功能分類PCR芯片，涵蓋生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域（詳見列表）。
※ 對照全面：5個管家基因，1個基因組DNA對照（GDC），3個反轉(zhuǎn)錄對照（RTC）和3個PCR對照（PPC）

康成生物功能分類PCR芯片主要實(shí)驗(yàn)流程
1.樣品RNA抽提
   a. 實(shí)驗(yàn)對象為組織樣品，取適量（50-100mg）新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品，使用BioPulverizerTM冰凍粉碎組織，加1ml的RNA抽提試劑TRIzol（Invitrogen），使用Mini- Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。
   b. 實(shí)驗(yàn)對象為細(xì)胞樣品，每份樣品取1×106～1×107細(xì)胞，加1ml的RNA抽提試劑TRIzol（樣品為貼壁細(xì)胞，每10cm2培養(yǎng)皿TRIzol使用量為1ml），裂解后抽提RNA。
2.DNase I 消化RNA樣品
   DNase I在 370溫育處理RNA樣品，去除RNA抽提過程中可能混入的的基因組DNA。
3.RNA純化
   RNeasy® MinElute™ 純化試劑盒（Qiagen）對DNase I處理的RNA樣品純化回收，已得到單純的RNA樣本。
4.RNA質(zhì)量檢測
   a)  使用Nanodrop測定RNA 在分光光度計260nm、280nm和230nm的吸收值，以計算濃度并評估純度。
   b) 用甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳，檢測RNA純度及完整性。
   c)  提供RNA QC報告。
5.cDNA合成
   按照逆轉(zhuǎn)錄酶（Invitrogen或Promega）使用說明將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA (根據(jù)樣品RNA質(zhì)量選用oligo dT或隨機(jī)引物)。
6.實(shí)時定量PCR
    按照芯片說明將cDNA模板適當(dāng)稀釋后加入到實(shí)時定量PCR反應(yīng)混合液中，然后再含有基因特異性引物的96孔板各孔中加入等量反應(yīng)液，進(jìn)行實(shí)時定量PCR反應(yīng)。
7.數(shù)據(jù)分析
    利用配套軟件計算PCR芯片中的各個基因的Ct值，采用公認(rèn)的DDCt方法比較基因的表達(dá)變化。
    a. 計算每個處理組中的每個通路相關(guān)基因的ΔCt 。
    ΔCt(Ctrl) = average Ct – average of HK genes’ Ct for Ctrl array
    ΔCt (Exp) = average Ct – average of HK genes’ Ct for Exp array
    b. 計算2個PCR Array中每個基因的ΔΔCt。
    ΔΔCt = ΔCt (Exp) - ΔCt (Ctrl)
    c. 通過2-ΔΔCt計算Exp（實(shí)驗(yàn)組）與Ctrl（對照組）間基因的表達(dá)差異。
8.提供實(shí)驗(yàn)報告
    Gene table（96孔板個基因列表）
    Excel芯片結(jié)果匯總表（包括芯片原始結(jié)果、數(shù)據(jù)分析和各種圖表）

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上�？党缮�物工程有限公司自2002年起專注于生物科研技術(shù)服務(wù)，是國內(nèi)最早一批專業(yè)提供生命科學(xué)前沿研究技術(shù)服務(wù)的高科技企業(yè)。為進(jìn)一步拓展在醫(yī)學(xué)科研服務(wù)領(lǐng)域業(yè)務(wù)的深度和廣度，向多譜領(lǐng)域發(fā)展，重塑品牌 Aksomics（數(shù)譜生物）。Aksomics全面整合公司在非編碼RNA（lncRNA、circRNA、small RNA等）、表觀遺傳學(xué)、蛋白組學(xué)等檢測方向的核心技術(shù)，依靠自身優(yōu)秀的研發(fā)、技術(shù)、營銷和服務(wù)團(tuán)隊(duì)，憑借國際領(lǐng)先的技術(shù)平臺和高標(biāo)準(zhǔn)的質(zhì)控體系，形成了涵蓋表觀基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)等各個研究領(lǐng)域的一站式技術(shù)平臺。

【表觀基因組學(xué)】 DNA甲基化芯片、DNA羥甲基化芯片、染色質(zhì)免疫共沉淀芯片、DNA甲基化測序、DNA羥甲基化測序、染色質(zhì)免疫共沉淀測序、MeDIP-PCR、hMeDIP-PCR、ChIP-PCR等

【轉(zhuǎn)錄組學(xué)】LncRNA芯片、LncPath™芯片、環(huán)狀RNA芯片、T-UCR芯片、microRNA芯片、piRNA芯片、全基因組表達(dá)譜芯片、RNA測序、RNA m6A甲基化測序、small RNAs測序系列（microRNA測序、tRF&tiRNA測序、snoRNA測序、piRNA測序等）、LC-MS tRNA修飾檢測、 nrStar™ ncRNA PCR芯片（tRF&tiRNA，tRNA，snoRNA，F(xiàn)unctional LncRNA）、miRStar™癌癥特異性microRNA PCR芯片、NuRNATM mRNA PCR芯片、功能分類PCR芯片、LncRNA實(shí)時定量PCR、環(huán)狀RNA實(shí)時定量PCR、tRF&tiRNA實(shí)時定量PCR、microRNA實(shí)時定量PCR、mRNA實(shí)時定量PCR

【蛋白組學(xué)平臺】TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)服務(wù)、Lable-free定量蛋白組學(xué)服務(wù)、磷酸化修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、泛素化修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、N-糖基化修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、乙�；�修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、蛋白-蛋白相互作用組學(xué)

【代謝組學(xué)】靶向代謝組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)

【外泌體組學(xué)】外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)、外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)、外泌體代謝組學(xué)
康成生物為Agilent、Arraystar、Exiqon、Illumina、Qiagen、Thermo Fisher等國際知名品牌提供技術(shù)服務(wù)。康成客戶采用各類技術(shù)服務(wù)發(fā)表的SCI論文已超560篇�？党缮�物將持續(xù)聚焦生命科學(xué)發(fā)展的挑戰(zhàn)，提供有競爭力的產(chǎn)品和服務(wù)，持續(xù)為客戶創(chuàng)造最大價值。

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