ProteinGo是一款用于蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析的集成分析系統(tǒng)，它能自動(dòng)化的完成來(lái)自IPI、RefSeq、UniProt、NCBI GenBank以及其他有序列信息的蛋白質(zhì)組鑒定結(jié)果的一系列分析，分析內(nèi)容包括基本理化性質(zhì)分析、GO功能分類(lèi)和富集分析、KEGG通路分析、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建分析。除蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)之外，系統(tǒng)還支持來(lái)自于芯片分析結(jié)果，測(cè)序結(jié)果等后續(xù)分析。

采用該系統(tǒng)分析的數(shù)據(jù)組數(shù)已經(jīng)超過(guò)５０組。

系統(tǒng)優(yōu)點(diǎn)：

• 自動(dòng)化的批處理分析，根據(jù)數(shù)據(jù)的不同，自動(dòng)化的完成一系列的分析；
• 豐富的圖表輸出，基本滿(mǎn)足發(fā)表文獻(xiàn)的要求；
• 排隊(duì)式的任務(wù)流程，不會(huì)導(dǎo)致服務(wù)器計(jì)算資源擁堵，或者服務(wù)器崩潰等問(wèn)題，而且對(duì)服務(wù)器配置的要求也不高；
• 友好的提交方式，采用網(wǎng)頁(yè)訪問(wèn)的形式進(jìn)行提交數(shù)據(jù)和返回分析結(jié)果；
• 靈活的可擴(kuò)展功能，因該軟件為自主開(kāi)發(fā)，可以根據(jù)客戶(hù)的要求增加或擴(kuò)展軟件功能；
• 無(wú)數(shù)據(jù)量限制，不會(huì)如一些免費(fèi)分析的網(wǎng)站一樣，提交數(shù)據(jù)超過(guò)2000就無(wú)法分析。

應(yīng)用范圍

• 蛋白質(zhì)組鑒定結(jié)果分析（非定量分析）；
• 表達(dá)譜芯片結(jié)果的后續(xù)分析；
• 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果的后續(xù)分析；
• 外顯子組測(cè)序結(jié)果的后序分析；
• 基因注釋的部分分析。

功能模塊

• 單組數(shù)據(jù)流程（IPI） 用于IPI搜庫(kù)結(jié)果的分析
• 單組數(shù)據(jù)流程（RefSeq） 用于RefSeq搜庫(kù)結(jié)果的分析
• 單組數(shù)據(jù)流程（UNIPROT） 用于UNIPROT搜庫(kù)結(jié)果的分析
• 單組數(shù)據(jù)流程（fasta） 用于序列的分析
• Human Official Symbol數(shù)據(jù)流程 用于Human official symbol的數(shù)據(jù)分析流程
• Gene Ontology分析
• KEGG Pathway分析
• 表格處理

上海生咨生物科技有限公司 是由新加坡海歸科研人員和資深生物醫(yī)藥信息學(xué)技術(shù)人員共同創(chuàng)辦的以生物醫(yī)藥信息學(xué)服務(wù)和實(shí)驗(yàn)外包為主的高科技企業(yè)。公司致力于生物醫(yī)藥信息技術(shù)與軟件的研發(fā)和服務(wù)，并結(jié)合合作伙伴的資源提供從技術(shù)咨詢(xún)、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)實(shí)施、數(shù)據(jù)分析一體的解決方案。公司的業(yè)務(wù)涉及基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和藥物設(shè)計(jì)的研究解決方案。