定量分析ChIP-qPCR數(shù)據(jù)的方法：Percent Input法和富集倍數(shù)法步驟介紹
ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對可變性來源進行標準化，包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率（富集效率）和 DNA 回收率。
兩種常用的標準化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法（Fold Enrichmen）。與input相關(guān)的ChIP-qPCR數(shù)據(jù)包括ChIP的背景水平和input染色質(zhì)的標準化。建議ChIP 實驗重復(fù)，盡可能將結(jié)果與背景信號和標準誤差一起顯示。
Percent Input法
使用這種方法，從ChIP獲得的信號除以從input樣本中獲得的信號。input樣本代表ChIP中使用的染色質(zhì)數(shù)量。通常1%的起始染色質(zhì)用作input。
示例：計算input百分比
注意：如果起始input為1%，則從稀釋input的Ct值中減去100或6.644 cycles（100的log2）的稀釋因子（DF）。
富集倍數(shù)法
這種標準化方法也稱為“背景信號”或“相對無抗體對照”。該方法將ChIP 信號除以無抗體信號，將ChIP信號表示為信號相對于背景信號的倍數(shù)增加。該方法建立在背景信號的水平在不同的引物組、樣品和重復(fù)實驗間可重復(fù)的假設(shè)上。背景信號水平在引物組、樣品和實驗之間有所不同。
兩種常用的標準化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法（Fold Enrichmen）。與input相關(guān)的ChIP-qPCR數(shù)據(jù)包括ChIP的背景水平和input染色質(zhì)的標準化。建議ChIP 實驗重復(fù)，盡可能將結(jié)果與背景信號和標準誤差一起顯示。
Percent Input法
使用這種方法，從ChIP獲得的信號除以從input樣本中獲得的信號。input樣本代表ChIP中使用的染色質(zhì)數(shù)量。通常1%的起始染色質(zhì)用作input。
示例：計算input百分比
注意：如果起始input為1%，則從稀釋input的Ct值中減去100或6.644 cycles（100的log2）的稀釋因子（DF）。
富集倍數(shù)法
這種標準化方法也稱為“背景信號”或“相對無抗體對照”。該方法將ChIP 信號除以無抗體信號，將ChIP信號表示為信號相對于背景信號的倍數(shù)增加。該方法建立在背景信號的水平在不同的引物組、樣品和重復(fù)實驗間可重復(fù)的假設(shè)上。背景信號水平在引物組、樣品和實驗之間有所不同。
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