2019年底爆發的新型冠狀病毒肺炎(corona virusdisease 2019,COVID-19),其病原體為SARS-CoV-2。隨著疫情的放開,感染人數激增,尤其是老年患者,新冠口服藥的需求愈發旺盛。根據媒體報道,2023年1月8日,新冠治療藥品阿茲夫定片、清肺排毒顆粒經過談判納入國家醫保目錄,而輝瑞的Paxlovid因報價高談判失敗。為保障新冠用藥,國家醫保局醫藥服務管理司的副司長黃心宇在1月11日的新聞發布會上表示,按現行的新冠藥品報銷政策,Paxlovid仍可臨時報銷至2023年3月31日。
當前,全球新冠口服藥的研發分為兩大技術陣營:以輝瑞Paxlovid為代表的3CL蛋白酶抑制劑路線和以莫那比拉韋(Molnupiravir)為代表的RdRp抑制劑路線。
3CL蛋白酶(3C-like protease, 3CLpro ),負責水解病毒多聚蛋白C端的大部分位點[1,2],也被稱為主蛋白酶(main protease, Mpro )。3CLpro對多聚蛋白的成熟起主要作用,是病毒復制繁殖的關鍵酶。它們在冠狀病毒中高度保守,是抗冠狀病毒疾病的重要藥物設計靶點[3],其晶體結構如圖1。3CL蛋白酶抑制劑的作用機制是能夠讓Mpro無法處理多蛋白前體,從而抑制新冠病毒在人體內的增殖。
圖1 SARS-CoV-2的Mpro同型二聚體(PDB: 6Y2E)的x射線晶體結構[2]
一項對已批準藥物和臨床候選藥物庫的高通量篩選顯示,有六種小分子,Ebselen、Disulfiram、Carmofur、Tideglusib、Shikonin和PX-12,可作為SARS-CoV-2 Mpro的抑制劑(圖2)。
圖2 SARS-CoV-2主蛋白酶Mpro抑制劑[2]
RNA依賴的RNA聚合酶(RdRp, 也稱為nsp12)是冠狀病毒復制/轉錄機制的核心成分,其結構如圖3。該結構也能夠為靶向設計藥物提供重要的結構基礎,有助于新冠藥物的研究。由于RdRp的活性位點高度保守,在不同的正鏈RNA病毒(如冠狀病毒)和HCV中結構相似,這一特征使得針對新冠病毒可以進行“老藥新用”, 并對開發泛冠狀病毒藥物提供良好的基礎。
圖3 COVID-19病毒nsp12的結構域組成和nsp12-nsp7-nsp8復合體結構[4]
Molnupiravir是一種核糖核苷類似物的前藥,作為一種誘變劑,其作用機制是誘導病毒RNA聚合酶和自己結合,進行錯誤復制,最終合成沒有感染性的假病毒(圖4)。
圖4 Molnupiravir分子結構及誘導RNA突變的兩步模型[5]
參考文獻
[1] Brian D A, Baric R S. Coronavirus genome structure and replication[J]. Current topics in microbiology and immunology, 2005:287.
[2] Ullrich S, Nitsche C. The SARS-CoV-2 main protease as drug target[J]. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2020, 30(17):127377.
[3] Anand, Kanchan, Ziebuhr, et al. Coronavirus Main Proteinase (3CL[suppro]) Structure: Basis for Design of Anti-SARS Drugs.[J]. Science, 2003.
[4] Gao Y, Yan L, Huang Y, et al. Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from COVID-19 virus[J]. Science, 368.
[5] Kabinger F, Stiller C, J Schmitzová, et al. Mechanism of molnupiravir-induced SARS-CoV-2 mutagenesis[J]. Nature Structural & Molecular Biology, 2021, 28(9).