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NHS活性酯熒光標(biāo)記詳細(xì)步驟、常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案指南
瀏覽次數(shù):691 發(fā)布日期:2025-4-17 來(lái)源:本站
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標(biāo)記原理
將熒光染料與蛋白,抗體及其他生物分子偶聯(lián)主要基于 NHS 酯反應(yīng)化學(xué), NHS 酯活化的熒光染料和待標(biāo)記化合物在生理至弱堿性條件下(pH 7至 9)與伯胺反應(yīng),形成穩(wěn)定的酰胺鍵,反應(yīng)釋放出 N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)。從而實(shí)現(xiàn)與蛋白,抗體的偶聯(lián)。
圖1 NHS酯化學(xué)偶聯(lián)到伯胺的反應(yīng)圖式
(R)表示具有NHS酯反應(yīng)基團(tuán)的熒光團(tuán)
(P)表示含有伯胺的蛋白質(zhì),抗體或其他生物分子
標(biāo)記前準(zhǔn)備
1) 實(shí)驗(yàn)物品準(zhǔn)備
:移液槍及一次性吸頭(0.5-10μL、2-20μL、20-200μL),恒溫孵育震蕩器,合適離心機(jī)。
2) 準(zhǔn)備活性染料酯母液
:粉末一般使用 DMSO 溶解,根據(jù)試劑的溶解性而定。母液應(yīng)分裝低于-20℃保存,避免反復(fù)凍存和受潮。
3) 標(biāo)記緩沖液配制
:標(biāo)記實(shí)驗(yàn)請(qǐng)自行準(zhǔn)備合適緩沖液,緩沖液應(yīng)具有適宜的 pH 和成分,例如: 10-50mM 的硼酸鈉溶液,PBS或碳酸氫鈉溶液 (pH 7.5- 8.5),應(yīng)不包括Tris,氨基酸等含伯胺的物質(zhì)。
4) 純化方式選擇
:純化方式試實(shí)驗(yàn)要求可選擇多種方式,實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)自行選擇純化方法。純化裝置包括 Zeba 脫鹽離心柱純化,Sephadex G-25 凝膠過(guò)濾柱純化,超濾管純化等。
注:推薦選擇超濾管純化,本司試劑盒產(chǎn)品配置有超濾管,超濾管使用前仔細(xì)請(qǐng)參看 Milipore 官網(wǎng)指南:Amicon Ultra-0.5 mL離心式過(guò)濾器,用于DNA和蛋白的純化及濃縮 - Sample Prep Centrifugal Filter Units (merckmillipore.com)
標(biāo)記步驟
1
置換緩沖液(選擇性操作)
若您的抗體或蛋白濃度較低,或儲(chǔ)備在含有游離氨基的溶液中(Tris,氨基酸等含伯胺的物質(zhì)),標(biāo)記前請(qǐng)用標(biāo)記緩沖液超濾置換抗體溶液。
2
標(biāo)記反應(yīng)量計(jì)算
每種染料標(biāo)記比選擇取決于染料類(lèi)型,蛋白類(lèi)型和實(shí)驗(yàn)?zāi)康模鏲y系列和蛋白最佳標(biāo)記摩爾比在 1:4-1:20 。為了獲得最佳的摩爾比例,可以要通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行摸索。每個(gè)標(biāo)記反應(yīng)染料的使用量取決于代標(biāo)記蛋白的質(zhì)量,濃度和分子量。在確定好大概摩爾標(biāo)記比的情況下,使用以下公式進(jìn)行計(jì)算染料投量:
● n(染料) 是標(biāo)記抗體Ab或蛋白計(jì)算所用的染料摩爾量;單位 mmol
● m(染料) 是標(biāo)記抗體Ab或蛋白計(jì)算所用的染料質(zhì)量,單位 mg
● a是投料摩爾標(biāo)記比(抗體:染料=1:n)
● m(Ab) 是待標(biāo)記抗體 Ab 或蛋白的總質(zhì)量,單位 mg
● M(Ab) 是抗體或蛋白的分子量,單位 Da
● M(染料) 是所用染料的分子量,單位 g/mol
計(jì)算好染料的摩爾使用量,換算為母液取用量,一般染料母液取用量不超過(guò)反應(yīng)體系的 10% 。
● V(取母液體積) 是所取染料的體積,單位μL
● c(母液濃度),是存儲(chǔ)母液濃度,單位mM
3
以投料比 1:5(蛋白與染料的摩爾比)的標(biāo)記實(shí)驗(yàn)
取出儲(chǔ)存的 2mM 染料母液,染料恢復(fù)至室溫,抗體或蛋白溶液置于 300μL 的標(biāo)記緩沖液反應(yīng)體系,對(duì)于標(biāo)記 0.1mg 的 IgG 抗體(150 KDa),立即取V = 5*0.1*106/(2*150000)μL=6.7μL,加入到體系內(nèi),震蕩均勻,染料可分多次加入震蕩,然后在室溫避光條件孵育 2 小時(shí)。
4
超濾純化(若使用超濾管)
標(biāo)記反應(yīng)完成后,轉(zhuǎn)移反應(yīng)液后以 12000g 離心超濾15min,去除游離的染料,超濾過(guò)程輕輕混勻溶液,避免觸碰到膜,至少操作超濾 2 次至濾液無(wú)色,最后一次倒置內(nèi)管超濾(4000g,1min),使?jié)饪s后的樣本從超濾內(nèi)管轉(zhuǎn)移到收集內(nèi)管中,得到標(biāo)記好的抗體即可使用,或置于 1%BSA 儲(chǔ)存液避光保存。
圖2 注:最佳標(biāo)記比例可能根據(jù)蛋白的差異而不同,用戶(hù)可根據(jù)實(shí)際情況優(yōu)化。超濾過(guò)程存在膜吸附,不影響后續(xù)使用。
標(biāo)記比及濃度計(jì)算
1)每種染料的偶聯(lián)率在 50%-90%,真實(shí)標(biāo)記比需借助紫外分光光度計(jì)測(cè)試計(jì)算。
2)使用紫外分光光度計(jì)掃描一定稀釋程度的樣本在 230nm~900nm 的吸收光譜,記錄A280的吸光度及染料最大吸收處的吸光度。
3)實(shí)驗(yàn)過(guò)程請(qǐng)注意調(diào)整兩個(gè)吸光度值的大小范圍,使蛋白的 280nm 的吸光度盡量處于 0.1-1 范圍。
4)結(jié)合相關(guān)數(shù)據(jù)計(jì)算公式如下:
實(shí)際標(biāo)記比總公式:
● A280是抗體在 280nm 的吸光度
● Aλmax是染料在最大吸收處的吸光度
● CF是染料對(duì) 280nm 處的吸光度的影響的校正因子,一般取0.03-0.07,參見(jiàn)染料信息
● εdye 和 εAntibody 是染料和抗體的摩爾消光系數(shù),IgG 抗體 εAntibody 一般 210000 cm-1M-1,εdye 參見(jiàn)染料信息
蛋白濃度公式:
以 BLT 800 標(biāo)記抗體為例標(biāo)記比則為:
標(biāo)記常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案
標(biāo)記過(guò)程中蛋白出現(xiàn)帶顏色沉淀
? 蛋白與染料的投料摩爾比過(guò)高(蛋白濃度過(guò)高,染料濃度過(guò)高)
✔ 首先降低投料摩爾比,若仍出現(xiàn),降低反應(yīng)體系投料蛋白量和相應(yīng)的染料量
? 反應(yīng)體系存在使待標(biāo)記物質(zhì)聚沉的物質(zhì),可能是蛋白不耐受ph,鹽濃度,被標(biāo)記后在體系聚沉
✔ 改變相應(yīng)條件嘗試
? 染料分子結(jié)構(gòu)特性的水溶性不高
✔ 選擇水溶性更高的染料,例如磺化的染料,但cy的波長(zhǎng)碳鏈越長(zhǎng)越高,水溶性越差,就算磺化后也會(huì)出現(xiàn)一點(diǎn)聚沉,只能通過(guò)其他方式減少聚沉
超濾純化過(guò)程蛋白出現(xiàn)聚沉
? 蛋白不兼容pH
✔ 調(diào)整 pH 在適合范圍
? 超濾過(guò)程蛋白濃度變化太大
✔ 注意一次標(biāo)記的蛋白濃度
超濾純化過(guò)程較慢
? 轉(zhuǎn)速不合適,超濾管截留分子量選擇不當(dāng)
✔ 轉(zhuǎn)速單位調(diào)為 xg 單位,若為 150KDa 的抗體,可更換超濾管 100KDa
蛋白標(biāo)記比較低
? 活性染料儲(chǔ)存使用不當(dāng),NHS活性酯遇水活性鍵在幾分鐘或幾小時(shí)完全失活,使得無(wú)法標(biāo)記
✔ 活性染料注意防潮,平衡室溫再打開(kāi)
? 標(biāo)記過(guò)程操作細(xì)節(jié)不當(dāng)
✔ 請(qǐng)按照說(shuō)明書(shū)調(diào)整,注意細(xì)節(jié)
? 蛋白緩沖液含有干擾組分如過(guò)量銨離子或含氨基物質(zhì)
✔ 標(biāo)記蛋白前正確置換緩沖液
? 光譜測(cè)定方法不準(zhǔn)確
✔ 請(qǐng)按照正確的吸收光譜方法測(cè)定
較低蛋白回收率
? 超濾膜損破(轉(zhuǎn)速過(guò)高破損)或過(guò)多裝液體漏液
✔ 檢查超濾膜及管芯不要裝過(guò)多液體
? 回收蛋白不當(dāng)
✔ 采取倒置離心回收蛋白
? 標(biāo)記過(guò)程或超濾過(guò)程,蛋白發(fā)生聚沉
✔ 超濾過(guò)程每管降低蛋白濃度,或加入少量氯化銨(20mM)及時(shí)終止反應(yīng)
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Cy系列染料
AF系列染料
ATTO系列染料
注:博鷺騰熒光標(biāo)記試劑盒暫時(shí)提供近紅外二區(qū)熒光染料標(biāo)記的全套試劑盒,對(duì)于其他波長(zhǎng)范圍的熒光標(biāo)記,博鷺騰有熒光染料NHS活性酯產(chǎn)品,對(duì)標(biāo)記過(guò)程稍加修改也可做此類(lèi)標(biāo)記。
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