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果蠅運動監視器DAM2的數據分析流程

瀏覽次數:720 發布日期:2025-2-18  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
美國Trikinetics果蠅運動監視器DAM2的數據分析
 
簡介:
美國Trikinetics 是一家專注于生物行為監測設備的公司,其DAM(Drosophila Activity Monitor)監視器主要用于果蠅(Drosophila)活動監測,廣泛應用于睡眠、晝夜節律及行為研究。
Trikinetics的DAM監視器憑借其高精度、模塊化設計和易用性,成為果蠅行為研究的理想工具。
 
DAM的原始數據:


由于監控文件(Monitor***.txt )是簡單的制表符分隔(tab-delimited)文本文件,因此也可以輸入到任何電子表格或數學應用程序,直接繪制圖表(plotting)或進行分析(analysis)。
Monitor***.txt文本文件每行(row)有42列(column),如上圖所示。綠色框代表有效數據,
紅色框代表monitor的編號,黃色框是數據類型(Ct, count,計數,果蠅阻斷紅外光束),褐色代表有光照(1代表白天,0代表黑夜),藍色代表阻斷紅外線的次數。
 
睡眠分析:
果蠅的睡眠定義為持續 5 分鐘或更長時間的不間斷行為不活躍(活動計數為 0)。因此,任何大于或等于五個連續零的時段(bin的長度1min)都被視為睡眠事件(sleep bout)。

 
果蠅的睡眠指標如上圖
 
數據分析流程:
 
DAM2的原始數據通過Trikinetics的DAMSystem3數據采集軟件獲得。原始數據可以通過各種軟件進行作圖和分析。Trikinetics的官網上提供了多種收費和免費的軟件,各有優劣。包括:ShinyR-dam,PySolo,SCAMP,Rythmically,Counting macro,Rethomics,VANESSA,SleepMat,Phase... 溪拓科技提供部分軟件的分析服務。
發布者:上海溪拓科學儀器有限公司
聯系電話:021-6019 5846
E-mail:liaolei@xtg-tech.cn

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