本文系鹿明生物原創，轉載請注明本文轉自鹿明生物

空間代謝組學(Spatial Metabolomics)結合了質譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)和代謝組學，利用離子源直接掃描生物樣品成像，不僅可以鑒定成千上萬種代謝物的結構和相對含量，還可以在同一張組織切片上同時分析大量代謝物的空間分布特征，為傳統代謝組學分析提供了全新的可視化視角，實現對代謝物進行定性、定量、定位三個維度的深入分析。

本文核心內容：

空間代謝組學在切片過程中需要注意哪些事項？

空間代謝組學檢測不同類型樣本的物質檢出情況如何？

首先，好的數據結果離不開前期的實驗處理。對于空間代謝組學的數據來說，其中成敗的關鍵一定離不開切片，線上的研究資料中很少詳細對空間代謝組切片的關注，鹿明生物經過多年的空間代謝組學研究經驗，梳理了部分切片攻略，接下來具體看看吧。

step1. 樣本核對

step2. 樣本固定及安裝

step3. 樣本修片

step4. 確認切面

step5. 正式樣本收集

step6. 切片檢查核對

其次，準確的數據結果離不開數據庫的貢獻，目前鹿明生物形成了一套標準化的多維度建庫流程，已經形成心、肝、腦、腎、肺、腫瘤等多種組織類型的空間代謝組專屬數據庫。

鹿明生物AFADESI空間代謝組學常測定出的腦組織代謝物主要包含有：5-羥色胺、乙酰膽堿、GABA、多巴胺、組氨、褪黑激素等，運用鹿明生物空間代謝組學數據庫鑒定腦組織中大類物質的檢出占比，如下圖所示：

鹿明生物AFADESI空間代謝組學常測定出的肝臟組織中代謝物主要有ATP、D-葡萄糖、草酰琥珀酸鹽等，運用鹿明生物空間代謝組學數據庫鑒定肝臟組織中大類物質的檢出占比，如下圖所示：

鹿明生物AFADESI空間代謝組學常測定出的腎臟組織中代謝物主要有N-乙酰組胺、磷酸絲氨酸、肌苷、果糖基賴氨酸等，運用鹿明生物空間代謝組學數據庫鑒定腎臟組織中大類物質的檢出占比，如下圖所示：

鹿明生物AFADESI空間代謝組學常測定出的腫瘤組織中代謝物主要有天冬氨酸、脯氨酸、次黃嘌呤、腺嘌呤等，運用鹿明生物空間代謝組學數據庫鑒定中腫瘤組織中大類物質的檢出占比，如下圖所示：

鹿明生物AFADESI空間代謝組學常測定出的肺組織中代謝物主要有L-乳酸、D-葡糖糖、水楊酸、檸檬酸鹽等，運用鹿明生物空間代謝組學數據庫鑒定中肺組織中大類物質的檢出占比，如下圖所示：

鹿明生物AFADESI空間代謝組學常測定出的心臟組織中代謝物主要有D-葡糖糖、熊果苷、草酰琥珀酸鹽、D-阿洛糖等，運用鹿明生物空間代謝組學數據庫鑒定中心臟組織中大類物質的檢出占比，如下圖所示：

鹿明生物的AFADESI-MSI空間代謝組技術，受到AFADESI-MSI原創團隊核心專家-賀玖明教授全力支持。自2021年1月1日起，已落地執行200+項目，已建立腦、心、肝、肺、腎、腫瘤組織等多種組織類型的空間代謝組自建數據庫。AFADESI-MSI平臺不涉及基質噴涂，定性到的物質中約30%為脂質類物質，約70%為700Da以下的小分子物質，可更均衡地涵蓋1000Da以下的小分子物質。

鹿明生物也是國內最早開始同時進行空間轉錄組與空間代謝組的公司。現已獲得多項實驗檢測、分析上的軟著及專利。基于AFADESI平臺發表的方法學及應用文章目前已在Gut、PNAS、Theranostics、Advanced Science、Analytical chemistry、Analytica Chimica Acta等期刊上發表相關文章10+篇。

鹿明生物提供優質的空間代謝組服務

空代儀器平臺已搭建：2套AFADESI-MSI質譜成像系統

項目執行：已落地執行項目百余項、檢測組織樣本類型20+；

定性算法經過多維校準：定性結果同時考慮物質表達空間情況、加和離子及同位素峰表達強度相似性、同位素表達空間分布相似性、非靶向質譜數據和空代自建數據庫進行校準。
 

項目實測結果：可實現定性代謝物數量：1000-3000個代謝物

無偏好性檢測代謝物：:70%為700Da以下的小分子物質，30%為脂質類物質，更加適合代謝組學研究方向。