文獻解讀：轉錄因子JUN介導的seRNA形成R環促進鼻咽癌轉移
近日，湖南省腫瘤醫院唐發清研究團隊在鼻咽癌轉移分子機制取得了新進展，相關研究成果已經發表在國際權威期刊《Cell Death & Disease》（IF=9.0、一區top期刊）上。
增強子是DNA遠端元件，在細胞類型特異性生物過程中可激活或增加相關基因的轉錄。 轉錄因子 (TF) 通過特殊的識別序列與這些增強子結合，并與輔助因子合作，在增強子和啟動子之間形成染色質環。據報道，超級增強子（SEs）是一系列增強子，也被稱為伸展增強子，存在于對細胞存活和腫瘤發生至關重要的基因附近，通過激活鄰近基因促進致癌過程。增強子（SEs）連接若干啟動子，通常與其目標基因相距數百個干堿基。與典型的增強子（TEs）相比，增強子含有更大的開放染色質結構域，其特征是高水平的H3K27乙酰化（H3K27ac），并富集用于TEs結合。SEs通常與RNA聚合酶II(RNAPII)結合，產生被稱為seRNA的雙向非編碼RNA。seRNAs或類似seRNA的非編碼RNAs的缺失會導致與之相關的蛋自編碼基因下調， seRNAs在腫瘤發生中發揮著重要作用。
鼻咽癌（NPC）是一種起源于異咽部、具有高度轉移潛力的惡性腫瘤。雖然鼻咽癌對放療敏感，但遠處轉移患者的預后仍然很差。 1,4-二硝基哌嗪（(DNP）是腌制食品中最主要的揮發性亞硝胺。一些研究表明，DNP可以在體內促進NPC癌變和轉移。
在本研究中，證明了一種新的鼻咽癌轉移分子機制。采用全局run-on測序、染色質免疫沉淀測序和 RNA測序相結合的方法篩選 seRNA一個與異咽癌轉移相關的特異seRNA (seRNA-NPCM）被鑒定為N-myc下游調控基因1(NDRG1）的轉錄調節因子。已證實主轉錄因子JUN對激活seRNA-NPCM的產生至關重要。從基因間區轉錄的seRNA-NPCM可促進鼻咽癌的體外和體內轉移。在鼻咽癌患者中，seRNA-NPCM 的表達預示病情不佳。SeRNA-NPCM在SE區域形成RNA-DNA環(R-loops），并與 NDRG1和 TRIB1 啟動子上的 hnRNPR結合，從而促進增強子-啟動子環形成和基因轉錄。seRNA-NPCM還與 ACTA1 直接相互作用。 這些發現對于闡明 seRNA-NPCM 在鼻咽瘤轉移過程中調節啟動子的分子機制具有重要意義。
seRNA-NPCM通過R環形成調節NDRG1和TRIB1的表達模型示意圖
為了證實seRNA-NPCM對于鼻咽癌的體內轉移的影響，作者使用了廣州博鷺騰生物科技有限公司的AniView系列多模式動物活體成像系統拍攝了鼻咽癌腫瘤的轉移過程，結果顯示seRNA-NPCM的表達能顯著增強體內鼻咽癌的轉移。
基于熒光素酶的生物發光成像對裸鼠鼻咽癌轉移性狀態的體內成像。
黃色箭頭：轉移結節
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