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DNA甲基化研究的三大前期探索性實(shí)驗(yàn)思路介紹

瀏覽次數(shù):674 發(fā)布日期:2023-3-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
大家好,這里是專注表觀組學(xué)十余年,領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。
近些年以來,DNA甲基化研究一直是頂級(jí)期刊、基金資助、臨床研究、藥物研發(fā)上市的多重?zé)狳c(diǎn),其研究方向涵蓋疾病發(fā)生發(fā)展、疾病標(biāo)志物研究、環(huán)境因素暴露與響應(yīng)、發(fā)育和分化等多維度。

 

研究人員為DNA甲基化課題申請(qǐng)作準(zhǔn)備以及為降低DNA甲基化實(shí)驗(yàn)風(fēng)險(xiǎn),通常會(huì)進(jìn)行DNA甲基化研究的前期探索性實(shí)驗(yàn),主要包括:
  • 檢測(cè)DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達(dá)
  • 檢測(cè)整體DNA甲基化水平變化
  • 其他前期實(shí)驗(yàn)

一、檢測(cè)DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達(dá)
方法包括:
  • RT-qPCR檢測(cè)mRNA表達(dá)
  • Western blot檢測(cè)蛋白質(zhì)翻譯

e.g. 高脂飲食組和肥胖人群中均觀察到DNMT的RNA和蛋白質(zhì)表達(dá)上調(diào)
 
二、檢測(cè)整體DNA甲基化水平變化
方法包括:
²  5mC甲基化免疫熒光染色(定性)
²  DNA斑點(diǎn)雜交(定性)
²  比色法(定量)
²  質(zhì)譜法(定量)
斑點(diǎn)雜交(Dot blot)
 
免疫熒光顯微觀察
 
比色法/質(zhì)譜法
 
三、其他前期實(shí)驗(yàn)
在沒有條件開展甲基化相關(guān)前期實(shí)驗(yàn)的情況下,也可以開展其他預(yù)實(shí)驗(yàn)。包括:
²  關(guān)鍵表型指標(biāo)測(cè)定
²  轉(zhuǎn)錄組(成本低廉)
 
在進(jìn)行前期探索性實(shí)驗(yàn)后,DNA甲基化的研究思路與項(xiàng)目設(shè)計(jì)還包括:技術(shù)選擇、數(shù)據(jù)挖掘、下游驗(yàn)證。
發(fā)布者:深圳市易基因科技有限公司
聯(lián)系電話:0755-28317900
E-mail:wuhuanhuan@e-gene.cn

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