1、傳染性疾病診斷
ELISA檢測在診斷測試中特別受歡迎，它可以應用于檢測傳染病原體本身和它們在宿主中引起的抗體反應，這取決于所選擇的檢測方法。因此，ELISA在識別可能構成感染威脅或需要治療的受感染者，以及在流行病學監測中識別以前被感染過的康復者方面都很有用。

一些慢性感染，特別是傳染源負荷上升和下降的情況下，如果單純依靠檢測傳染源，可能很難發現。然而，在這些人中可以檢測到持續的抗體反應，即使微生物本身不能檢測到，也有助于準確定位這些人。

第一個人類免疫缺陷病毒（HIV）的通用測試方法是在1985年開發的，是一種測定人類血清胱抑素C的ELISA檢測。許多其他疾病可以用ELISA診斷人類和動物，包括登革熱、乙型肝炎、SARS-CoV-2、馬氏鏈球菌和大腸桿菌。

lipoarabinomannan（LAM）ELISA檢測是一種檢測方法，用于測定結核病（TB）患者尿液中的LAM，一種免疫原性的霉菌細胞壁抗原。鑒于與結核病有關的全球流行率和死亡率以及替代性結核病診斷的挑戰，它是一種急需的篩查工具。然而，它的靈敏度水平和臨床效用一直受到批評。

但是，很多科學家都在努力解決這些問題。已有人將該測試擴展到其他樣本類型，包括痰和血清，但可惜的是成效不大。

2、食物過敏原的檢測
過敏原如果被受影響的人攝入，可能是致命的，所以對于食品來說，宣布不含某些過敏原，如花生，是至關重要的。

ELISA為此提供了極好的靈敏度，在某些情況下可低至百萬分之一（ppm），并且能夠應對一些食品類型，如油和奶，而其他方法如PCR則難以應對。然而，一些食品的加工過程，如加熱會改變過敏原構象，這會對ELISA測定產生負面影響。

3、生物仿制藥和生物制藥檢測

隨著生物仿制藥的發展，有必要證明它們與它們要模仿參考藥物之間的相似性。在這里，ELISA也發揮了在確定藥物總濃度和檢測雜質等因素方面的效用[22]。

4、癌癥生物標志物測試

癌癥生物標志物通常可以在血液樣本中檢測出來。因此，ELISA測試可以作為一種非侵入性的方法，用來測定和量化已知的生物標志物。

5、法醫藥物檢測

ELISA檢測可被毒理學家用于篩選法醫樣品中的濫用藥物痕跡，包括安非他命、可卡因、鴉片制劑、美沙酮、苯并二氮雜卓和大麻素。雖然液體樣品，如尿液或血液比較容易處理，但也可以對固體樣品，如頭發，進行ELISA分析。

6、懷孕測試

人絨毛膜促性腺激素（hCG）是懷孕時產生的一種激素，可以通過ELISA在尿液樣品中檢測。

7、自身免疫性疾病

指示自身免疫性疾病的標志物，如類風濕性關節炎和紅斑狼瘡，可通過ELISA測定和定量。

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