瞬時轉染（Transient transfection）是廣泛使用的制造方法之一，具有快速開發、靈活度高、可以生產多種rAAV等優勢。其工藝開發工作集中于細胞系工程、克隆篩選、質粒配置改進和工藝優化上。粘附瞬時轉染（aTT）主要用于科研小規模rAAV生產和材料的生成，將質粒替換為不同的目標基因，使用單個宿主細胞系就可以生產多個構建體，縮短篩選和開發時間。然而，aTT工藝的可拓展性和制造一致性仍存在不少挑戰。使用aTT進行rAAV生產需要大量實驗員進行操作，勞動密集程度高，同時可能導致批次間重復性差，流程難以驗證等問題。
 

懸浮瞬時轉染（sTT）能夠在攪拌罐生物反應器中放大細胞培養，同時降低液體處理的要求，近年來被認為是更理想的解決方案。有研究成功開發出高表達的細胞系并成功放大至數百升的生物反應器中。

桿狀病毒表達載體系統（Baculovirus expression vector systems）具有利于放大擴展、相較于哺乳動物細胞平臺的體積生產率更高、不含動物成分等優點。但仍存在載體蛋白比率不一致，翻譯后修飾等問題，阻礙了大規模rAAV生產的實施。

生產細胞系（Producer cell lines）系統被認為是成本低、穩定性高、可拓展的生產平臺。其主要缺點是前期獲得穩定的工程細胞系需要耗費大量時間和資源。隨著基因治療的商業化，市場將需要更高產量更低成本的產品，應運而生的則是可誘導生產細胞系（iPCL）系統。該系統利用化學誘導啟動子調控基因的表達，同時具有可拓展、穩定性高、產量高的優勢。誘導表達同時還可以減少基因表達的副作用，如細胞死亡、生產延遲等。利用該系統rAAV的生產可以分為細胞生長和病毒載體產生階段。細胞生長階段可以采用高密度細胞培養工藝來增加生物量。

有研究表明，使用小體積平行生物反應器可以借助高通量與平行性的優勢來做DOE實驗，幫助快速篩選合適培養基、微載體以及工藝參數。也有團隊通過平行生物反應器開展灌流工藝獲得了更高的單位體積產量。
 

Minibox CloudReady云反應器可根據用戶需求增加數量幾百套上千套生物反應器，沒有數量限制，輕松實現高通量。采用先進實驗室信息管理系統（LIMS）概念、項目制管理，實現分布式控制。強大的軟件可以將所有事件從配方執行到歷史記錄，所有的操作記錄將自動收集并整合到詳細的批量報告中。開展更多實驗的同時降低實驗成本，并大幅提高了實驗室效率，讓工藝開發的平臺能力飛躍提升。