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RNA提取實(shí)驗(yàn)操作步驟及注意事項(xiàng)

瀏覽次數(shù):541 發(fā)布日期:2022-6-8  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
操作步驟:
1、準(zhǔn)備工作

A、 玻璃勻漿器、75℅乙醇預(yù)冷 ,離心機(jī)預(yù)冷至4℃ 打開超凈工作臺(tái)紫外燈15分鐘以上
B、 用酒精擦拭臺(tái)面 EP管標(biāo)記

2、勻漿處理
1、取一定量的純化過的孢子懸浮液,12000rpm ,離心5min,棄上清
a 、或者用勻漿儀進(jìn)行勻漿處理,懸浮液不經(jīng)離心,直接加0.5ml Trizol reagent于冰上充分勻漿懸浮液樣品體積一般不要超過Trizol體積的10%.,然后再加入0.5ml Trizol 沖洗勻漿器,轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管中
b、 直接在懸浮液中加入Trizol裂解細(xì)胞,加1ml Trizol.用取樣器吹打幾次.(離心取細(xì)胞,每5-10×106動(dòng)物、植物和酵母細(xì)胞或每107細(xì)菌細(xì)胞加1ml Trizol。加Trizol前不要洗滌細(xì)胞,以免降解mRNA。一些酵母和細(xì)菌細(xì)胞可能需要?jiǎng)驖{儀處理)

2、1ml Trizol Reagent,震蕩混勻

3、將勻漿樣品在15-30℃放置5mim,使得核酸蛋白復(fù)合物完全分離。

4、可選步驟:4 ℃ 12 000rpm離心10min,取上清。
如果樣品中含有較多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物結(jié)節(jié)部分等,可離心去除。離心得到的沉淀中包括細(xì)胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。處理脂肪組織樣品時(shí),上層是大量油脂,應(yīng)除去。取澄清的勻漿溶液進(jìn)行下一步操作。

5、每使用1ml Trizol加0.2ml氯仿,蓋好管蓋,在漩渦振蕩器上震蕩15s,室溫放置3min。如不能渦旋混勻,可手動(dòng)顛倒混勻2min代替。

6、4 ℃ 12 000rpm,離心10-15min,樣品會(huì)分成三層:紅色的有機(jī)相,中間層和上層無色的水相,RNA主要在水相中,把水相(約600ul,約為所用Trizol試劑的60%)轉(zhuǎn)移到新管中。(如要分離蛋白質(zhì)和DNA,可保留黃色的有機(jī)相)

7、在得到的水相溶液中加入等體積(500ul)的異丙醇,上下顛倒混勻,-20℃ 放置20-30min。
(植物或動(dòng)物組織RNA提取中,容易沉淀出大量的蛋白等污染物,導(dǎo)致電泳檢測(cè)時(shí)看不到RNA。可以按以下步驟操作減輕污染:在上清中加入1/2體積的異丙醇,1/2體積的RNA助沉劑,然后進(jìn)行以下操作。)

8、4 ℃ 12 000rpm離心10min,去上清。
(離心前RNA沉淀經(jīng)常是看不見的,離心后在管側(cè)和管底形成膠狀沉淀。)

9、加入1ml 75%乙醇(DEPC水處理過的水配制)洗滌沉淀。加入后把管子敲一敲,盡量使RNA沉淀飄起來,每使用1ml Trizol至少加1ml乙醇。有時(shí),為避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗滌之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能過于干燥,否則不易溶解。

10、4 ℃ 12 000rpm離心5min,棄上清;短暫快速離心,用移液器小心吸棄上清,注意不要吸棄沉淀。

11、室溫放置晾干(不要晾得過干,RNA完全干燥后會(huì)很難溶解,大約晾干2-3min左右即可)。加入適量DEPC水(根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要,可加30-100ul水)或0.5%SDS,用槍頭吸打幾次,充分溶解RNA。50度保溫1小時(shí)。如RNA用于酶切反應(yīng),勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅ 的去離子甲酰胺。溶解,-70℃保存。可以分裝保存,防止污染,

12、取1ul+1ul buffer 電泳檢測(cè)RNA完整性,稀釋一定倍數(shù),分光光度計(jì)測(cè)定純度和濃度。

注意事項(xiàng):

1. 從少量樣品中提取RNA(1-10mg組織或102-104細(xì)胞) :

加800ul Trizol,樣品裂解后加氯仿,分層,沉淀RNA前,加5-10ug RNase-free糖原,糖原會(huì)與RNA一同沉淀出來,糖原濃度不高于4mg/ml時(shí)不會(huì)影響反轉(zhuǎn)錄cDNA第一鏈的合成,也不影響PCR反應(yīng)。

2. 勻漿后,加氯仿前,樣品可在-70 ℃放置一個(gè)月以上:

RNA沉淀可以保存在75%酒精中,2-8 ℃一個(gè)星期或-20 ℃一年以上。如果要長期保存,RNA可以溶解于100%去離子甲酰胺中,-70 ℃長期保存。
 

發(fā)布者:上海邦景實(shí)業(yè)有限公司銷售部
聯(lián)系電話:021-52960951
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