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實驗過程中核酸降解的預防手段與方法

瀏覽次數:4144 發布日期:2022-4-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

導語

在實驗過程中,最心累的莫過于好不容易提取的核酸卻降解了。那么核酸為什么會發生降解呢,我們又該如何預防呢?關于核酸降解,你了解多少呢?讓我們一起對核酸降解一探究竟吧。

   什么是核酸   

核酸是一種高分子化合物,核苷酸是構成核酸的基本單位。核酸水解后得到許多核苷酸,核苷酸是組成核酸的基本單位,即組成核酸分子的單體。

一個核苷酸分子是由一分子含氮的堿基、一分子五碳糖和一分子磷酸組成的。根據五碳糖的不同可以將核苷酸分為脫氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。如果5-碳糖是核糖,則形成的聚合物是RNA;如果5-碳糖是脫氧核糖,則形成的聚合物是DNA。

   核酸降解本質   

核酸降解是DNA/RNA分子中的堿基和戊糖間的氮糖苷鍵,或磷酸二酯鍵在物理因素、化學因素和生物因素等作用下發生水解,使DNA/RNA鏈發生斷裂。

核苷磷酸化酶:能分解核苷生成含氨堿基和戊糖的磷酸酯酶。廣泛存在于生物體內,催化的反應可逆?稍诤塑账饷缸饔孟吕^續分解核苷成嘌呤堿、嘧啶堿和戊糖。

核苷水解酶:主要存在于植物和微生物體內,只水解核糖核苷。

   核酸降解原因   

DNA降解的因素很多,主要分為物理因素,化學因素和生物因素。

一、物理因素:溫度,機械剪切力、核酸的反復凍融、高溫煮沸及輻射等。

二、化學因素:PH值,水解反應,氧化反應等。

三、生物因素:酶解及微生物侵染等作用。

一、物理因素的影響

★ 溫度:高溫條件下,RNA不穩定,易加速磷酸二酯鍵的水解,使核酸降解;

★ 機械剪切力:包括劇烈震蕩、攪拌、細胞突然至于低滲溶液中,以及讓溶液快速通過狹長的孔道;

★ 核酸的反復凍融、高溫煮沸及輻射等,均會導致核酸的降解。

二、化學因素影響水解

★ PH值:氫離子參與催化磷酸二酯鍵、糖苷鍵的水解,但糖苷鍵比磷酸二酯鍵更易被酸水解。過高或過低的PH值都易破壞復鍵。核酸(特別是RNA)在堿性溶液中十分容易降解;

★ 氧化反應:會氧化堿基中的含氨雜環,使其變性,從而改變一級與二級的核酸構象;

★ 苯酚在空氣中被氧化生成醌,它能夠產生自由基,直接用于DNA的分離,會使磷酸酯鍵斷裂,造成DNA的降解。

三、生物因素影響

★  酶解:核酸酶可以催化水解多聚核苷酸鏈中的磷酸二酯鍵,直接破壞核酸的一級結構,使其降解。

1.核酸酶(磷酸二酯酶)

核酸內切酶:在環境或生物體內具有識別雙鏈DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA雙鏈的核酸內切酶統稱為限制性核酸內切酶。作用方式從多聚核苷酸鏈中間開始,在某一個位點切斷磷酸二酯鍵。如DNase,RNase等。

核酸外切酶:核酸外切酶的作用方式是從多聚核苷酸鏈的一端(3'-端或5'-端)開始,逐個水解切除核苷酸。如蛇毒磷酸二酯酶,牛脾磷酸二酯酶等。

2.核苷酸酶(磷酸單酯酶)

專一性的磷酸單酯酶:3'-核苷酸酶,5'-核苷酸酶

非專一性磷酸單酯酶。

★  微生物侵染:微生物會將DNA作為營養物質或是其分泌的化學物質含酶。

   預防降解的方法   

預防RNA降解的方法:

★ 去除環境中RNase酶的污染或強有力地抑制其活性。

★ 獲取樣品后最好立即提取RNA,若無條件立即實驗,應于-80℃液氮中保存樣品,提取時取出樣品后立即在低溫下研磨裂解細胞,以防RNA降解。

★ 在總RNA提取分離的最初階段,聯合使用Rnase的特異抑制劑,盡可能的滅活胞內的Rnase的活性。

★ 避免樣品的反復凍融。

★ 保證裂解液的質量,裂解液的用量不足,也會導致RNA降解。

★ RNA提取后,放入-80℃保存,防止降解。

預防DNA降解的方法:

★ 簡化操作步驟,縮短提取過程,以減少各種有害因素對核酸的破壞;

★ 減少化學物質對DNA的降解,為避免過酸、過堿對DNA雙鏈中磷酸二酯鍵的破壞;

★ 防止基因組DNA的生物降解,主要是DNase降解基因組DNA,Dnase需要二價金屬陽離子Mg2+等的激活,可用EDTA等金屬離子整合劑整合Mg2+以抑制Dnase的活性;

★ 減少物理因素對DNA的降解,物理降解因素主要包括機械剪切力(如劇烈震蕩、攪拌等);

★ 避免樣品的反復凍融,可將DNA分裝保存于緩存液中;

★ 所有試劑應用無菌水配制,耗材經高溫滅菌;

★ 避免DNA的過高溫處理等。

發布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯系電話:0512--86860010
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