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Azure Cielo™ 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)在快速可靠地檢測新冠病毒的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1937 發(fā)布日期:2021-11-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

在應(yīng)對病毒性大流行疾病時(shí),為了有效控制病毒傳播和減少感染人群,快速且可靠的診斷是至關(guān)重要的。那么目前檢測COVID-19的 "黃金標(biāo)準(zhǔn) "依賴于一種成熟的技術(shù),即反轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈反應(yīng),也叫RT-qPCR。簡而言之,這一程序包括RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄成互補(bǔ)DNA或cDNA,以及用熱循環(huán)儀對轉(zhuǎn)錄本(病毒基因組的特異性)進(jìn)行實(shí)時(shí)定量。

為了早期檢測和診斷,實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀必須能夠檢測非常少量的病毒RNA。研究表明,檢測限(LOD)或以>95%置信度檢測到的最低RNA濃度,表示每1μL可能只有1拷貝的病毒RNA。因此,我們準(zhǔn)備用COVID-19 RNA來確定Azure Cielo™的LOD。
 

材料和方法

Azure Cielo™ 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)的LOD或分析靈敏度使用FDA批準(zhǔn)的COVID-19 genesig® Real-Time PCR assay進(jìn)行檢測,如使用說明書(IFU)所述。使用試劑盒提供的陽性對照模板(PCT)生成6點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)曲線,如下所示:
 

▲ 表1. PCT系列稀釋液
 

SARS-CoV-2全基因組RNA從歐洲病毒全球檔案館(EvaG)獲得,并按照IFU中的描述進(jìn)行連續(xù)稀釋,每個(gè)稀釋液進(jìn)行20次重復(fù)。
 


 

結(jié)果和討論

通過表1的PCT稀釋液得到標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖1),將病毒RNA/μL的拷貝數(shù)與Cq值關(guān)聯(lián)起來。
 

▲ 圖1. 標(biāo)準(zhǔn)曲線
 

數(shù)據(jù)顯示,在12.5cp/μL、1.25cp/μL和0.625cp/μL時(shí),Azure Cielo™ 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)均檢測到20/20(100%)的重復(fù),Cq平均值分別是30.49(圖2,綠色)、33.66(圖2,黃色)和34.80(圖2,橙色)。在0.06cp/μL時(shí),檢測到12/20(60%)的重復(fù),Cq平均值37.12(圖2,紅色)。
 

▲ 圖2. 病毒拷貝數(shù)與Cq值的關(guān)系

結(jié)果表明,針對SARS-CoV-2 RNA的檢測,Azure Cielo™實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)的最低檢測限LOD為0.625cp/μL,表明Azure Cielo™ 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)可用于快速可靠地檢測COVID-19。


Azure Cielo™實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)

Azure Cielo™實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)來自于美國Azure Biosystems公司,配備高品質(zhì)溫度模塊,采用光纖和CMOS的檢測系統(tǒng),高能LED的激發(fā),提供高靈敏和可靠的數(shù)據(jù)。
 

發(fā)布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯(lián)系電話:0512--86860010
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