利用MALDI-TOF微生物質譜技術推進傳染病檢測
利用MALDI-TOF微生物質譜技術推進傳染病檢測
作者：Ike Northern，CompuNet臨床實驗室傳染病檢測與免疫學主任
全世界每年有20%的死亡與敗血癥有關，影響人口達4700萬～5000萬。¹ 對敗血癥的早期識別與適當治療，可有效改善患者預后。敗血癥治療每延遲一小時，患者的存活率就會降低7.6%。2
治療敗血癥的標準程序從使用廣譜抗菌藥物開始，但是，在不了解微生物特性的情況下，治療的效果十分有限，并有可能給患者帶來不利的健康影響。很多曾經很容易通過新型抗生素治療的疾病，現在又重新出現了耐藥性。
利用MALDI-TOF技術進行快速微生物鑒定
CompuNet臨床實驗室可提供包括敗血癥檢測在內的先進診斷服務。該實驗室使用布魯克的基質輔助激光解吸/電離飛行時間（MALDI-TOF）微生物質譜儀來生成質譜圖，供鑒定微生物的“蛋白指紋圖譜”之用，從而顯著提高通量。
CompuNet還采用布魯克的MALDI Sepsityper® Kit 50（僅供研究用，即RUO），它可以直接從陽性血液培養物（PBC）中快速鑒定微生物。采用MALDI Sepsityper Kit 50從PBC中進行鑒定比傳統的表型與生化方法要快得多。
患者可以更快轉到靶向治療，除了盡量減少長期接受潛在的過度治療之外，從廣譜抗菌藥物迅速降級為靶向型抗菌藥物的另一項優勢是，降低產生多藥耐藥微生物的風險，這與世界衛生組織（WHO）的全球耐藥行動計劃相一致，3
CompuNet使用MALDI Biotyper進行MALDI Sepsityper Kit 50驗證研究，并對82%的樣本進行了鑒定，醫生能比之前提前至少48小時優化患者治療（表1）。CompuNet還計劃采用新近獲FDA批準的MBT Sepsityper Kit US IVD，對陽性血培養中的400多種微生物進行快速、經濟的鑒定。
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種水平
74/106 = 70% |
屬水平
13/106 = 12% | ||||||
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金黃色葡萄球菌 |
17 |
屎腸球菌 |
2 |
摩根摩根菌 |
1 |
凝固酶陰性葡萄球菌 |
3 |
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頭狀葡萄球菌 |
2 |
咽峽炎鏈球菌 |
1 |
銅綠假單胞菌 |
3 |
α-鏈球菌 |
1 |
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表皮葡萄球菌 |
8 |
A群鏈球菌 |
1 |
普通變形桿菌 |
1 |
β-鏈球菌 |
1 |
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溶血性鏈球菌 |
2 |
B群鏈球菌 |
1 |
粘質沙雷菌 |
2 |
芽孢桿菌屬 |
3 |
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人葡萄球球菌 |
2 |
陰溝腸桿菌 |
1 |
白色念珠菌 |
1 |
棒桿菌屬 |
3 |
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藤黃微球菌 |
3 |
大腸桿菌 |
18 |
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腸桿菌屬 |
1 |
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糞鏈球菌 |
4 |
肺炎克雷伯菌 |
5 |
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擬桿菌屬 |
1 |
表1：CompuNet MALDI Sepsityper Kit 50驗證
鑒定微生物總數 – 87/106（82%）
用戶長期受益
與通過多重PCR檢測進行PBC常規測試相比，使用MALDI-Sepsityper作為篩選手段是更為經濟高效的選擇，可以幫助確定該下一步該做哪些檢查。布魯克未來開發的目標包括增加耐藥標志物，以幫助應對耐多藥微生物 （如產肺炎克雷伯菌碳青霉烯（KPC）、MRSA（耐甲氧西林金黃色葡萄球菌）、脆弱擬桿菌陽性菌株、伊麗莎白菌屬以及嵌合體分枝桿菌），并進一步擴大微生物鑒定能力。
有關布魯克 MALDI Sepsityper Kit 50的更多信息，請登錄：https://www.bruker.com/products/mass-spectrometry-and-separations/ivd-ce-certified-maldi-biotyper/mbt-sepsityper-ivd-kit.html.
Bruker MALDI Sepsityper Kit 50僅供研究使用（RUO）。
*CompuNet臨床實驗室從布魯克購買MALDI Sepsityper Kit 50（RUO）
*CompuNet臨床實驗室開發并驗證了自己的內部分析方法，用于臨床診斷
*Sepsityper分析按照內部制定的方案僅在實驗室內使用。
關于作者
Ike Northern自1989年起在俄亥俄州代頓市的Compunet臨床實驗室工作，并擔任傳染病檢測主管。
參考文獻
¹ World Sepsis Day (2021) https://www.worldsepsisday.org/sepsis
2Kumar A, Roberts D, Wood KE, Light B, ParrilloJE, Sharma S, Suppes R, Feinstein D, ZanottiS, Taiberg L, Gurka D, Kumar A and Cheang M:Duration of hypotension before initiation of effectiveantimicrobial therapy is the critical determinantof survival in human septic shock. Crit CareMed 2006, 34(6):1589-96, DOI:
3Global Action Plan on Antimicrobial Resistance, World Health Organization (WHO), 2015, https://www.who.int/antimicrobial-resistance/publications/global-action-plan/en/index.html
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