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病毒蛋白樣半胱氨酸蛋白酶在抗COVID-19藥物設計的結構框架的應用

瀏覽次數:1454 發布日期:2020-5-8  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

2020年4月29日,由Wioletta Rut, Mikolaj Zmudzinski等人在bioRxiv期刊發表了《Activity profiling of SARS-CoV-2-PLpro protease provides structural framework for anti-COVID-19 drug design》的文章,文中使用Sappphire對B-Ub-VME標記SARS-CoV和SARS-CoV-2-PLpro蛋白進行掃描成像,并使用Azure spot軟件進行數據分析。

文章摘要

病毒蛋白樣半胱氨酸蛋白酶(PLpro, NSP3)是SARS-CoV-2抗病毒藥物研發的一個潛在靶點,有助于藥物研發,在這里,我們使用含有天然和多種非蛋白質的組合底物文庫,并對SARS-CoV-2-PLpro進行了全面的活性分析。我們發現SARS-CoV-2-PLpro的P2位點對Gly具有高度特異性,P3位點表現出很高的非特異性,P4位點優先顯示結合具有疏水性的氨基酸側鏈。

我們還證明了SARS-CoV-2-PLpro具有去泛素化活性,底物結合特征曲線和去泛素化活性高度相關。在定位掃描的基礎上,我們設計了最佳的熒光基質和不可逆抑制劑,研究SARS PLpro變體對其他蛋白酶的選擇性。總之,這項工作揭示了控制PLpro底物特異性的分子規則,并為開發具有潛在治療價值的藥物提供了框架。

文中使用Sappphire對B-Ub-VME標記SARS-CoV和SARS-CoV-2-PLpro蛋白進行掃描成像,并使用Azure Spot軟件進行數據分析。

發布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯系電話:0512--86860010
E-mail:info@aperbio.com

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