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接二連三,看大牛如何做有望實現(xiàn)臨床轉化的大隊列研究

瀏覽次數(shù):4658 發(fā)布日期:2019-4-29 
 代謝組學技術的興起加快了生物標志物的篩選工作,每年都有大量的文獻發(fā)表。很遺憾的是絕大數(shù)文章的研究隊列小規(guī)模較小,只是屬于前瞻性的研究,離真正走入臨床應用還有很長一段距離。

小編注意到國內在肝癌、冠心病、結直腸癌等領域已經(jīng)有了多篇大規(guī)模的報道,其中中國藥科大學臨床代謝組學中心主任齊煉文教授一直走的是大隊列研究路線。投入大量時間、金錢的背后動機,無外乎是希望實現(xiàn)科研到臨床應用的轉化。小編今天想跟給位老師介紹齊煉文教授團隊接二連三發(fā)表的幾篇大隊列研究。

2016年,中國藥科大學臨床代謝組學中心主任齊煉文教授等人在國際心血管領域頂級期刊Journal of the American College of Cardiology發(fā)表文章《Comprehensive Metabolomic Characterization of Coronary ArteryDiseases》。原文鏈接:http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-ZJJJ201604042.htm

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研究團隊利用UPLC-Q/TOF-MS對2324份血漿臨床樣本進行了非靶向代謝組學分析,鑒定到89個與冠心病發(fā)生發(fā)展表型特征密切相關的差異代謝物,其中包括磷脂相關代謝通路抑制、氨基酸代謝增強、;鈮A類代謝通路激活、膽汁酸代謝減弱等多種代謝紊亂特征。

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進一步從差異代謝物庫中篩選出12組靈敏度高(>85%)、專屬性強(>85%)的代謝標志物群,繪制了冠心病及其在不同臨床階段(冠脈硬化癥、穩(wěn)定型心絞痛、不穩(wěn)定型心絞痛、心肌梗死)的血漿代謝組學特征譜。ROC分析顯示,12組代謝標志物群診斷能力良好。

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在16年文章的基礎上,2017年齊煉文教授等人在心血管領域頂級期刊Circulation上發(fā)表文章《Functional Metabolomics Characterizes a Key Role for N-Acetyl-neuraminic Acid in Coronary Artery Diseases》。原文鏈接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29212895

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在16年研究的基礎上,研究人員發(fā)現(xiàn)36種代謝物與冠心病的發(fā)生發(fā)展密切相關,隨后通過靶向代謝進一步證實N-乙酰神經(jīng)氨酸(Neu5Ac) 在血漿中的水平與冠心病事件呈顯著正相關,為冠心病進展相關的代謝標志物。

研究人員發(fā)現(xiàn)N-乙酰神經(jīng)氨酸(Neu5Ac)作為信號分子,可選擇性結合Rho家族中的RhoA和Cdc42,激活Rho-ROCK信號通路誘發(fā)心肌損傷。后續(xù)分子、細胞和動物水平的深入探索,發(fā)現(xiàn)抑制N-乙酰神經(jīng)氨酸上游調控蛋白神經(jīng)氨酸酶,可以有效緩解心肌缺陷所導致的心肌細胞損傷。這一結果為冠心病藥物研發(fā)提供了新的靶點,也為早已上市的神經(jīng)氨酸酶抑制劑奧塞米韋和扎那米韋的藥物再定位開拓了新思路。

近日,齊煉文教授等人在胃腸肝病學領域頂級期刊Gastroenterology上發(fā)表文章《Tyrosine and Glutamine–leucine are Metabolic Markers of Early-stage Colorectal Cancers》。

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齊煉文教授等人對健康人、代謝綜合征患者(MS)以及結直腸癌患者(CRC)三組共3482例血清樣本進行了代謝組學檢測。

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首先研究團隊對篩選隊列的360例樣本進行了非靶向代謝組學分析,發(fā)現(xiàn)30種組間顯著變化的差異代謝物。隨后對驗證隊列的1594例樣本進行非靶向代謝組學分析,7種代謝物得到進一步的驗證,并被初步篩選為潛在生物標志物;诰性回歸分析的結果表明Glu-Leu和酪氨酸具有良好的結直腸癌診斷能力,并選取驗證隊列中的900例樣本進行靶向檢測驗證。最后又繼續(xù)對預測隊列的1528例樣本進行了靶向檢測,進一步評價panel的診斷能力,結果表明Glu-Leu和酪氨酸對健康人 vs 結直腸癌患者(CRC)、代謝綜合征患者(MS) vs 結直腸癌患者(CRC)的診斷能力良好,可作為結直腸癌的早期診斷生物標志物。

研究團隊利用UPLC-Q/TOF-MS對2324份血漿臨床樣本進行了非靶向代謝組學分析,鑒定到89個與冠心病發(fā)生發(fā)展表型特征密切相關的差異代謝物,其中包括磷脂相關代謝通路抑制、氨基酸代謝增強、;鈮A類代謝通路激活、膽汁酸代謝減弱等多種代謝紊亂特征。

小編心得

1.   真正有望走向臨床應用的代謝標志物一定是上千例的大隊列研究,投入與產(chǎn)出成正比。

中科新生命(APT)可以給客戶提供基于非靶向代謝組學的代謝標志物篩選,或基于DIA的蛋白標志物篩選的解決方案,并且曾經(jīng)參與過一項標志物篩選方向的精準醫(yī)療研究,項目經(jīng)驗豐富,頗有心得,歡迎感興趣的老師前來咨詢。

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APT的產(chǎn)品優(yōu)勢:

對于這種上百例、上千例的大樣本檢測,采集時間長,APT采用的是不同于小樣本檢測的一套特殊的數(shù)據(jù)采集模式,并且時刻監(jiān)控整個實驗過程的儀器狀態(tài)。

非靶代謝:2700+基于標品的代謝物二級譜圖數(shù)據(jù)庫+人工二次確認,雙重保證定性結果的可靠性。在不久的將來,APT還會推出MetDNA技術(放一下之前軟文的鏈接),鑒定的代謝物數(shù)量也會大大提升。

DIA:最新推出成熟的DIA服務,目前2000多個樣本已經(jīng)下機,尤其是血漿樣本,無須去除高豐度,無須分級,上機2h,單個樣本可獲得1000+蛋白,也是大隊列標志物篩選、分子分型研究的首選技術。

APT質控體系:

對于非靶向代謝組學和DIA等產(chǎn)品,中科新生命采用更高標準的質控體系,多項評價內容全面客觀的監(jiān)測儀器的系統(tǒng)穩(wěn)定性,評價數(shù)據(jù)質量好壞。

APT實驗室資質優(yōu)勢:

中科新生命有嚴格的實驗管理系統(tǒng),并且通過CMA認證、ISO9001質量管理體系認證、室間質評,是值得放心的選擇。

發(fā)布者:上海中科新生命生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-54665263
E-mail:marketing@aptbiotech.com

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