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羅氏FFPET組織樣本抽提RNA試劑盒實驗結果分析

瀏覽次數:6484 發(fā)布日期:2015-2-28  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

High Pure FFPET RNA Isolation Kit基于離心柱法的抽提原理,在柱上直接進行高效DNase消化,在整合的實驗流程中方便地去除殘留DNA。

圖1:抽提獲得寬泛的RNA片段范圍,FFPET RNA抽提物片段長度范圍在100-4000bp

使用3中不同的方法從乳腺癌組織的5um FFPET樣品中抽提總RNA。綠色線顯示了使用該方法抽提獲得的RNA長片段極少,以RNA降解片段為主。灰色線顯示的RNA抽提物覆蓋的片段范圍較廣,但在短片段RNA的分布存在較大的偏倚性。

結果:羅氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit的抽提產物(藍色線)較均勻地覆蓋了整個片段分布范圍。


圖2:從近期和長期保存的FFPET樣品中均可抽提獲得高RNA得率
    A)柱形圖顯示了從結腸癌組織和正常結締組織10um FFPET切片樣本中抽提獲得的RNA平均得率(n=24)樣本保存時間分別為<6個月和>5年。
結果:羅氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit能獲得更高得率的RNA抽提產物。
    B)顯示了圖A的最左側兩列柱狀圖,其24個重復樣本各自的RNA得率。24個重復樣本來自于組織的連續(xù)切片,以避免來自不同組織區(qū)域的核酸含量差異。
結果:在常規(guī)研究中,同一組織樣本的不同FFPET切片的核酸得率存在差異。但對于同一種樣本,羅氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit始終能獲得更高得率的RNA抽提產物。

圖3:從樣品中抽提獲得高質量的RNA,提高RT-aPCR檢測靈敏度。

作為qPCR實驗中的核酸模板,要求高質量的RNA,即良好的核酸得率、純度和片段大小分布,并能高靈敏度和不偏倚地檢測模板基因的表達情況。

從3中不同異種移植物切片組織中抽提RNA,取150ng總RNA,使用Transcriptor Universal cDNA Master進行反轉錄反應,取10ng cDNA產物通過LightCycler 480 Real-Time PCR Instrument擴增檢測ALAST基因表達情況。

結果:High Pure FFPET RNA Isolation Kit抽提獲得的RNA模板(n=8)能在RT-qPCR實驗中獲得更高的檢測靈敏度。

產品信息

產品

目錄號

包裝規(guī)格

High Pure FFPET RNA Isolation Kit

06 650 775 001

50次抽提反應

閱讀原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2015020028.html

發(fā)布者:杭州聯(lián)科生物技術股份有限公司
聯(lián)系電話:4006721600
E-mail:network@liankebio.com

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