技術優勢
數字化信號:測序直接獲得序列,無背景噪音,無交叉雜交;可鑒別序列間單個堿基的差異;
高通量:一次測序得到千萬條以上的序列;
檢測閾值寬:跨越6個數量級的寬檢測閾值,從幾個到數十萬個拷貝精確計數;
良好的重復性:深度測序保證了抽樣隨機性,重復性非常好,無需重復實驗;
高靈活性 :依據客戶需求,提供不同測序平臺服務。
產品應用
醫學上的應用方向——
農學上的應用方向 ——
研究內容
標準信息分析:
1. 基本數據統計① 去除接頭序列、低質量序列得到reads信息,② 樣品相關性,③ 表達量分布,④ RNA分類;
2. 參考基因組比對;
3. mRNA鑒定;
4. mRNA定量分析;
5. mRNA差異表達分析(樣本間、組間);
6. mRNA表達/差異基因聚類;
7. mRNA差異基因GO分類、富集;
8. mRNA差異基因KEGG分類、富集。
Dr.Tom信息分析:
一)數據庫注釋
1. 轉錄因子注釋(AnimalTFDB/PlantTFDB);
2. GSEA分析;
3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro數據庫注釋;
二)互作網絡分析
1. 靶基因分析① miRNA-mRNA靶向關系分析,② lncRNA-mRNA靶向關系分析;
2. ceRNA互作網絡分析;
3. 蛋白互作網絡分析;
4. 共表達互作網絡分析;
三)特色分析
1. 自定義標簽和自有數據上傳;
2. 外部數據庫信息(TCGA、ARCHS4);
3. 關鍵驅動基因網絡圖分析;
4. 時間序列分析。
(*以上分析內容為部分物種可做。)
定制化信息分析:
1. 可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。