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RNA-Seq
RNA-Seq,對某一物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的mRNA進行高通量測序,可以提供定量分析,檢測基因表達水平差異。
服務類別:測序/合成總訪問:272
最后更新:2022-10-14半年訪問:67
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  • 服務介紹
  • 公司簡介
RNA-Seq,對某一物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的mRNA進行高通量測序,可以提供定量分析,檢測基因表達水平差異。

技術優勢

數字化信號:測序直接獲得序列,無背景噪音,無交叉雜交;可鑒別序列間單個堿基的差異;

高通量:一次測序得到千萬條以上的序列;

檢測閾值寬:跨越6個數量級的寬檢測閾值,從幾個到數十萬個拷貝精確計數;

良好的重復性:深度測序保證了抽樣隨機性,重復性非常好,無需重復實驗;

高靈活性 :依據客戶需求,提供不同測序平臺服務。

 

產品應用

醫學上的應用方向——

 

圖片6

農學上的應用方向 ——

圖片7

研究內容

標準信息分析:

1. 基本數據統計① 去除接頭序列、低質量序列得到reads信息,② 樣品相關性,③ 表達量分布,④ RNA分類;

2. 參考基因組比對;

3. mRNA鑒定;

4. mRNA定量分析;

5. mRNA差異表達分析(樣本間、組間);

6. mRNA表達/差異基因聚類;

7. mRNA差異基因GO分類、富集;

8. mRNA差異基因KEGG分類、富集。

Dr.Tom信息分析:

一)數據庫注釋

1. 轉錄因子注釋(AnimalTFDB/PlantTFDB);

2. GSEA分析;

3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro數據庫注釋;

二)互作網絡分析

1. 靶基因分析① miRNA-mRNA靶向關系分析,② lncRNA-mRNA靶向關系分析;

2. ceRNA互作網絡分析;

3. 蛋白互作網絡分析;

4. 共表達互作網絡分析;

三)特色分析

1. 自定義標簽和自有數據上傳;

2. 外部數據庫信息(TCGA、ARCHS4);

3. 關鍵驅動基因網絡圖分析;

4. 時間序列分析。

(*以上分析內容為部分物種可做。)

定制化信息分析:

1. 可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。

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