講座背景:
最近Vevo Therapeutics聯合Parse Biosciences等團隊共同發布了Tahoe-100M,這是目前全球規模最大的癌癥單細胞藥物擾動數據集。該數據集包含1.006億個高質量單細胞轉錄組細胞,覆蓋50種癌細胞系、1100+藥物擾動。現在Tahoe-100M數據集已經集成到Talk2Data中。
在當今生物醫學研究中,多組學數據整合和分析已成為理解復雜生物系統的重要手段。如何高效管理和利用這些龐大的數據集,將是一個巨大的挑戰。
Talk2Data是一個GPU加速的公共單細胞數據探索平臺,包含512M+細胞。科學家可以利用Talk2Data數據庫實時整合多個數據集,并進行下游分析,包括稀有細胞群體的組成、差異表達、通路富集、相關性和marker基因鑒定。目前,來自100多家制藥公司的科學家正在使用該平臺來提出假設、確定靶標和加速生物發現。
為了更好的了解Talk2Data的功能,我們將舉辦一場線上講座,介紹如何利用Talk2Data進行跨研究分析:
如何快速找到感興趣的單細胞數據集?
如何創建個性化的單細胞圖譜?
探索感興趣的基因在不同的細胞類型、組織或者疾病中的表達
哪些細胞類型在疾病狀態下高度表達某種基因?
探索兩種疾病的細胞類型組成的差異
哪些基因與特定基因共表達?
如何識別區分不同細胞類型的Marker基因?
與健康狀態相比,疾病中哪些基因上調/下調?
BBrowserX能夠高效管理和可視化單細胞數據,實現界面化交互探索分析,包括AUCell富集,差異表達及熱圖分析,通路富集,擬時序分析,細胞通訊,子聚類和亞型分析等。
講座詳情:
▶ 本次線上講座將由上海康昱盛的應用工程師Xander Wei主持,他將展示Talk2Data單細胞數據庫的強大功能,并通過實際案例分享如何探索Tahoe-100M中的藥物擾動數據。
▶ 為保證培訓效果,名額有限,大家盡早報名!
講座時間:
▶ 6月19日(周四)15:00-16:00
報名方式:
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