Blast2GO介紹：

Blast2GO是一款面向生物學家的集成解決方案，用于基于基因本體詞匯表對DNA或蛋白質序列進行高通量和自動功能注釋的軟件。Blast2GO通過精心設計的算法優化同源序列的功能轉移，該算法考慮相似性、同源性擴展、選擇的數據庫、GO層次結構以及原始注釋的質量。該工具包括用于注釋結果的可視化、管理和統計分析的眾多功能，包括基因集富集分析。該應用程序支持InterPro、enzyme codes、KEGG途徑、GO有向無環圖（DAG）和GOSlim。Blast2GO因其多功能性、安裝簡便且使用友好而成為植物基因組學研究的合適工具。相信很多生物工程師對這個軟件十分熟悉。

Blast2GO應用示意圖  (Conesa A, Götz S. Int J Plant Genomics. 2008;2008:619832.）

Blast2GO是BioBam開發的產品，適用于（但不限于）非模式物種且用戶友好，只需很少的生物信息學工作即可運行。Blast2GO原先作為一個獨立的模塊，現在已經并入到OmicsBox的功能分析模塊中。

Blast2GO在基因組學和蛋白組學中的應用：

微陣列實驗、蛋白互作網絡研究、基因組/轉錄組分析或單核苷酸多態性 （SNP）觀察是獲得分子生物學新見解的有前途的方法。功能注釋是數據分析的關鍵步驟。由于高通量測序技術的快速發展和全球低成本表達序列標簽（EST）測序項目的增多，出現了越來越多的新穎、未定性的序列數據，這就要求進行快速、可靠的功能注釋，以促進相關實驗的生物學解釋。因此，標準化的功能注釋至關重要。基因本體（Gene Ontology，GO）是基因和蛋白質序列最廣泛的功能注釋模式，它已成為幾乎所有公共數據庫的事實標準。

1.利用帶有Blast2GO功能模塊進行全基因組功能注釋，我們可以對基因組從頭測序的CDS序列進行功能注釋。

1）通過BLAST進行序列比對；

2）通過InterProScan進行域搜索；

3）使用EggNOG-Mapper進行直系同源組搜索；

4）基因本體圖譜。

GO注釋條形圖

2.利用帶有Blast2GO功能模塊為差異表達數據進行富集分析。

表格中組合途徑分析結果的部分視圖

Reactome和KEGG數據庫中每個類別發現和通路富集數量以及可視化

3.利用帶有Blast2GO功能模塊為蛋白進行功能注釋與富集分析。

使用Blast2GO分析對從牛、綿羊、山羊和水牛的奶油中分離出的免疫系統相關蛋白質進行功能注釋和富集(Felice,Valeria D et al.Foods(Basel,Switzerland).Nov.2021)

講座主題：

轉錄組學&蛋白組學富集分析(OmicsBox功能分析)

講座時間：

3月28日（周四）16:00-17:00

主講嘉賓：

Stefan Götz，BioBam首席執行官，畢業于瓦倫西亞理工大學并獲得生物信息學博士學位。2011年，Stefan創建了BioBam并任BioBam的首席執行官。

軟件介紹：

OmicsBox由不同的模塊組成，每個模塊都有一組特定的工具和功能，旨在執行不同類型的分析，例如從頭基因組組裝、遺傳變異分析、差異表達分析和微生物組數據的分類學分類，包括功能解釋和豐富的結果可視化。功能分析模塊包括流行的Blast2GO注釋方法，使OmicsBox特別適合非模式生物研究。已有15000+的科學研究引用，適用于任何裝有Windows、Linux或Mac的標準PC或筆記本電腦。

報名方式：

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注：報名截止日期為3月27日。入會鏈接（Zoom）將于3月27日發送至您報名的郵箱，如未收到請聯系我們！

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