講座背景：

蛋白質質譜法是指使用質譜法對蛋白質進行研究和表征，包括蛋白質的定量、分析、相互作用作圖和翻譯后修飾的鑒定。蛋白質質譜法也可以稱為基于質譜的蛋白質組學�；�于質譜的蛋白質組學包括三種方法：自上而下（top-down，TD）、自中而下（middle-down，MD）和自下而上（bottom-up，BU）的蛋白質組學：

Mascot是一個基于HTTP網絡服務的平臺，支持用戶從本地或在線提交任意數量的譜圖進行搜庫鑒定和定量分析。其由Server、Distiller與Daemon 組成，其中Server負責執行核心搜索、Distiller負責峰提取與定量分析，而Daemon作為操作平臺，整合前兩個板塊，以便更高效地進行批量處理。

（來源于：https://www.rapidnovor.com/what-is-protein-mass-spectrometry/）

本次講座聚焦于TD蛋白質組學的數據分析。TD技術以完整蛋白質為對象，"上"指準確測定分子質量，"下"通過串聯質譜實現碎裂。TD法產生的質譜數據復雜，包含高電荷、大質量離子碎片，碎片重疊增加，修飾位點更多，不同修飾組合導致蛋白質變體預測增多。相較于BU肽段的數據處理，完整蛋白質的譜圖更為復雜，數據處理更具挑戰。

（來源于SUN Rui-Xiang, LUO Lan, CHI Hao, LIU Chao, HE Si-Min. Top-down Proteomics:The Large-scale Proteoform Identification[J]. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2015, 42(2): 101-114）

Mascot的特殊版本"Mascot Top Down"限制在110kDa，自動用于母離子質量大于16kDa的搜索，小于16kDa的自下而上搜索不受影響�？店攀⑹荕ascot在中國的獨家代理與技術支持機構，本期康昱盛將分享Top-Down蛋白質組學數據策略，包括數據上傳、峰提取參數、搜索參數設置和結果導出，助您熟練運用Mascot軟件解決Top-Down蛋白質組學挑戰。

講座時間：

1月24日（周三）14：30-15：20

講座詳情：

上期講座《一節課讓你學會使用Mascot進行基礎蛋白質定量分析》已經同步上傳至康昱盛同名B站以及視頻號。

此外，我們計劃在2月中下旬舉辦第四次Mascot培訓，重點介紹如何聯用Mascot-Scaffold系列軟件進行蛋白質數據質控分析。感興趣的朋友們，請持續關注康昱盛官方公眾號獲取更多信息！

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