2022年7月14日,湖南省益陽市資陽區對集中隔離醫學觀察點隔離人員例行正常核酸檢測時,發現省外涉疫地區返資人員一例核酸檢測初篩陽性。
7月15日中午,市委市政府向華大智造發出對核酸檢測陽性樣本進行新冠溯源分析的邀請。受領任務后,華大智造緊急調運最新款DNBSEQ-E5測序儀、新冠溯源ATOPlex建庫試劑和技術支持人員馳援益陽市疾控中心。
基因測序設備于7月15日夜間運抵市疾控中心,技術支持人員現場裝機、連夜奮戰,市疾控中心檢測檢驗人員于當日22時開始對資陽區疾控中心在7月15日早晨采集的樣本進行處理、建庫、上機測序,7月16日11時許獲得測序結果。病毒序列全長覆蓋率99.5%,確定分型為BA.2.2毒株。
圖1:益陽市疾控裝機的DNBSEQ-E5首次新冠病毒測序過程
此前,國家發改委等四部門聯合印發了《“十四五”優質高效醫療衛生服務體系建設實施方案》,方案中指出,國家和重點區域疾病預防控制機構需具備新發傳染病病原體、健康危害因素“一錘定音”檢測能力和重特大公共衛生事件處置能力。
此次益陽市疾控中心在華大智造基因測序設備加持下,快速準確完成新冠溯源分析,標志著益陽市疾控中心初步具備了對新冠病毒進行基因測序的能力,為益陽市新冠肺炎疫情以及其他傳染病的病原體鑒定溯源、應急處置提供了強大的技術支撐。
華大智造基于DNBSEQ技術的新冠病毒靶向測序產品組合,已幫助全國十余省近百家疾控中心進行新冠溯源病毒,為疫情防控工作提供有效依據,全面助力各地新冠病毒鑒定與溯源工作。而采用了微流控測序載片和集成信號采集模塊的DNBSEQ-E5快速測序儀,攜同ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1緊急響應,已連續部署至超過10個新冠疫情熱點地區,測序結果表現優異,高效完成新冠溯源。
圖2:華大智造DNBSEQ-E5助力多地新冠溯源工作
目前,基于全新優化加速的DNBSEQ-E5及其快速測序試劑進行SE100測序,最快可在3.5小時內完成從DNB加載至FASTQ文件輸出的全流程。測序完成10分鐘內輸出新冠病毒變異位點基因注釋、變異支系鑒別、全長序列,支持移動部署,能夠即時響應特殊樣本的緊急測序需求,適用于一線海關、疾控等機構。
作為生命科技核心工具締造者的華大智造,一直深知公共衛生、精準醫療等多個應用領域對于縮短樣本周轉時間的期待。我們將持續致力于打造更快、更便捷的基因測序儀等生命科學核心設備,為應對快速發現、準確變異跟蹤的疫情防控需求提供硬核支撐保障。