【課程簡介】
學生信一次報班從此以后再也不用東拼西湊反復報名各類培訓班，
系統學生信，一次學到位，包教包會。
二個月從零基礎開始，精細化講解 將生信內容全部學懂（理解）、學會（會敲代碼分析）、學透徹（站在頂層設計角度理解）、學以致用（用到自己的標書申請和文章發表中）
學不會一直學，直到學會才畢業
【授課老師】
華哥：中山大學博士 指導過多篇CNS文章生信分析 參與多項國自然重點、國家重大專項、孔雀計劃等項目申報 有多年生信教學經驗，學員遍布協和、華西、湘雅、瑞金、中山醫等著名醫院
【課程安排】每周二四六晚上每節課三個多小時
第一節課：r語言基礎學習 包括r和rstudio的安裝、環境配置、數據結構等基礎內容學習
第二節課：在實戰中進一步提升對r語言的學習，主要以geo的芯片數據下載、整理、分析為主。
第三節課：芯片數據分析（主要系統指導如何使用geo數據庫畫生存曲線，以及無進展、無疾病、多分組的的生存曲線畫圖，包括熱圖 火山圖 箱線圖 小提琴圖 ）
第四節課：rnaseq數據分析（包括系統講解主流的Deseq2、Edger、limma-voom三種差異分析的方法）
第五節課：基因集富集分析 gsva gsea kegg go富集 包括自定義基因集的富集分析以兩篇nature子刊文章為例，系統講解如何進行參數調整得到符合文章趨勢的富集結果
第六節課：tcga 數據下載 整理 差異分析 結果畫圖展示
第七節課：非監督共識聚類算法系統講解以兩篇cell文章為例 通路分組的生存曲線 轉錄因子富集
第八節課：wgcna算法系統講解以nature文章為例，系統講解三種免疫浸潤的算法，以及三種算法的具體應用場景和區別以及參數調整技巧
第九節課 ：單細胞數據讀取以nature文章為例，創建seurat對象 質控 s4對象的數據結構的系統講解
第十節課:繼續以nature文章為例系統闡釋降維、聚類等概念，細胞亞群注釋三種方法
第十一節課：多個樣本整合的單細胞數據分析 包括錨定和harmony兩種主流的單細胞數據整合算法，同時講解多線程運算原理和實操。
第十二節課：單細胞差異分析 metadata理解 分組添加 可視化畫圖 熱圖 氣泡圖
第十三節課：以nature文章為例系統auc算法計算通路活性，單細胞差異基因的富集分析 gsea 亞群的gsva  auc 轉錄因子預測
第十四節課：系統講解擬時間分析 包括monocle2 和monocle3 做3d擬時間
第十五節課：系統講解scenic算法 轉錄調控網絡分析
第十六節課：系統講解cellphonedb、cellchat、italk三種主流分析細胞互作的軟件
第十七節課：infercnv和以cell文章為例的自定義算法的染色體拷貝數變異
第十八節課：單細胞非負矩陣 cnn降維 非共識聚類 以及單細胞的wgcna
第十九節課：以cell文章為例 系統講解單細胞的RNA velocity應用
第二十節課：系統學習linux操作系統 chipseq全流程分析以nature文章為例 包括質控 上數據比對 、MACS2、IGV進行可視化
第二十一節課：chipseq下游的motif富集 不同處理直接的峰值overlap韋恩圖 差異paek尋找 peak注釋 以cell文章為例超級增強子尋找
第二十二節課：Atacpseq全流程分析包括MappingQC、多個重復樣本合并、Peakcalling、bedGraphToBigWig、TSS Enrichment、bedtools計算overlap、IDR評估、可視化。
第二十三節課：WES分析、gatk使用、VCF下游分析、annovar注釋
第二十四節課： 單細胞空間轉錄組的注釋以及可視化
第二十五節課：以優秀標書為例，講解如何將所學生信分析應用于國自然標書申請+課程大總結
 
【主辦單位】
瑋瑜科研平臺（上海瑋瑜生物科技有限公司）
【承辦單位】
上海瑋瑜生物科技有限公司
上海焦務科技服務中心
【培訓時間】
2022年1月4日開始
【注冊費用】
注冊費用：8800元/人
可開會務、注冊、檢測、分析服務等發票
【繳費賬號】
A：匯款賬戶
戶 名：上海焦務科技服務中心  賬戶號：9734 0078 8012 0000 0311
開 戶 行：上海浦東發展銀行大華支行 
B：支付寶轉賬
收款人：wybiot@163.com   支付寶戶名:上海瑋瑜生物科技有限公司
C：信用卡或公務卡支付
微信或支付寶掃描二維碼支付，通過信用卡/公務卡扣款
【聯系人】
聯系人：謝老師 13611825136     
報名郵箱： wybiot@126.com

參考附件：報名回執表