250篇同行評議發(fā)表論文見證454測序的成功
羅氏旗下子公司454生命科學(xué)近日公布第250篇利用Genome Sequencer系統(tǒng)的、經(jīng)同行評議發(fā)表的高水平論文。研究人員正利用Genome Sequencer FLX的高準確率和超長序列讀長來迅速獲得高質(zhì)量的生物學(xué)相關(guān)結(jié)果。這些結(jié)果醞釀出突破性的論文發(fā)表，讓454測序成為新一代測序技術(shù)中發(fā)表論文速度最快的一種，僅在2008年第二和第三季度就有超過80篇論文發(fā)表。
這些研究跨越了測序應(yīng)用的多個方面：82篇全基因組測序論文包括比較基因組學(xué)的從頭測序和重測序；54篇小分子RNA研究；37篇聚焦快速興起的宏基因組學(xué)；27篇關(guān)于轉(zhuǎn)錄組圖譜分析，包括全轉(zhuǎn)錄組拼接和表達圖譜；13篇研究染色體結(jié)構(gòu)和表觀遺傳學(xué)；10篇有關(guān)稀有變異檢測的超深度測序這個新領(lǐng)域；11篇研究古老DNA。其余的文章關(guān)注454測序系統(tǒng)的技術(shù)和生物信息學(xué)。多種多樣的應(yīng)用彰顯出454測序系統(tǒng)應(yīng)對重要研究領(lǐng)域的能力，包括那些傳統(tǒng)意義上無法用測序來解決的領(lǐng)域。
250篇經(jīng)同行評議的發(fā)表論文代表了開創(chuàng)性的研究，其中許多發(fā)表在最高水平的雜志上，包括：Nature 20篇、Science 13篇、Cell 6篇、Genome Research 20篇、PNAS24篇。到目前為止發(fā)表的論文覆蓋了多個不同的研究領(lǐng)域，如癌癥研究、傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學(xué)、人類學(xué)和古生物學(xué)。除了這250篇論文，還有許多綜述文章，探索了454測序的目前應(yīng)用和未來潛力。
一個星期內(nèi)的多篇關(guān)鍵論文的發(fā)表讓454相關(guān)論文總數(shù)超過了250。其中兩篇題為“對人染色體8q24上與前列腺癌和結(jié)腸癌相關(guān)的136 kb區(qū)域的綜合重測序分析”和“利用超深度測序揭示癌癥的亞克隆系統(tǒng)發(fā)育結(jié)構(gòu)”的文章彰顯GS FLX系統(tǒng)能精確鑒別出疾病相關(guān)區(qū)域的遺傳變異，以及鑒定出癌癥樣品中的低豐度體細胞突變。第一項研究是由美國國立癌癥研究院完成的。研究人員利用經(jīng)典鳥槍法對目標基因組區(qū)域進行測序，從而鑒別出與癌癥相關(guān)的雜合體變異。第二項研究中，英國Wellcome TrustSanger研究院利用454超深度擴增子測序，來檢測新且罕見的變異，包括多種B細胞慢性淋巴細胞白血病樣品抗體重鏈區(qū)的單核苷酸多態(tài)性（SNP）、插入和缺失。這些研究以及其他的研究論文可以在羅氏454網(wǎng)站（ ）上找到。
454測序系統(tǒng)除了為多項研究領(lǐng)域開辟了基因組分析之路，同時也加速了探索的步伐。研究、分析、撰寫并提交論文，經(jīng)同行評議后發(fā)表，按照傳統(tǒng)技術(shù)通常來說需要一年左右的時間。而利用Genome Sequencer系統(tǒng)發(fā)表研究成果的速度，顯然表明454測序結(jié)果的數(shù)據(jù)質(zhì)量高，且分析簡單。
454生命科學(xué)的總裁兼CEO Christopher Mcleod解釋到：“如此迅速達到250篇同行評議的發(fā)表論文，說明研究人員能輕松闡釋454的序列數(shù)據(jù)，并作出生物學(xué)上有意義的結(jié)論。454生命科學(xué)高質(zhì)量的超長讀長與易用的分析工具相結(jié)合，讓我們的客戶能更集中精力于科學(xué)，而不是技術(shù)。因而項目能快速完成，接著踏上新的研究道路。”
454 生命科學(xué)是羅氏應(yīng)用科學(xué)旗下卓越的中心之一，開發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測序系統(tǒng)，用于超高通量的DNA 測序。具體的應(yīng)用包括基因組的從頭測序和重測序、宏基因組學(xué)、RNA 分析和DNA 目標區(qū)域的定向測序。454 測序系統(tǒng)的特點是樣品制備簡單且無偏向性，讀長包括配對末端讀長超長且準確度高。454 測序系統(tǒng)的技術(shù)已經(jīng)催生了各個研究領(lǐng)域的幾百項經(jīng)同行評議的研究，例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋
生物學(xué)、人類學(xué)、古生物學(xué)等多個方面。更多信息，請查看http:///。
這些研究跨越了測序應(yīng)用的多個方面：82篇全基因組測序論文包括比較基因組學(xué)的從頭測序和重測序；54篇小分子RNA研究；37篇聚焦快速興起的宏基因組學(xué)；27篇關(guān)于轉(zhuǎn)錄組圖譜分析，包括全轉(zhuǎn)錄組拼接和表達圖譜；13篇研究染色體結(jié)構(gòu)和表觀遺傳學(xué)；10篇有關(guān)稀有變異檢測的超深度測序這個新領(lǐng)域；11篇研究古老DNA。其余的文章關(guān)注454測序系統(tǒng)的技術(shù)和生物信息學(xué)。多種多樣的應(yīng)用彰顯出454測序系統(tǒng)應(yīng)對重要研究領(lǐng)域的能力，包括那些傳統(tǒng)意義上無法用測序來解決的領(lǐng)域。
250篇經(jīng)同行評議的發(fā)表論文代表了開創(chuàng)性的研究，其中許多發(fā)表在最高水平的雜志上，包括：Nature 20篇、Science 13篇、Cell 6篇、Genome Research 20篇、PNAS24篇。到目前為止發(fā)表的論文覆蓋了多個不同的研究領(lǐng)域，如癌癥研究、傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學(xué)、人類學(xué)和古生物學(xué)。除了這250篇論文，還有許多綜述文章，探索了454測序的目前應(yīng)用和未來潛力。
一個星期內(nèi)的多篇關(guān)鍵論文的發(fā)表讓454相關(guān)論文總數(shù)超過了250。其中兩篇題為“對人染色體8q24上與前列腺癌和結(jié)腸癌相關(guān)的136 kb區(qū)域的綜合重測序分析”和“利用超深度測序揭示癌癥的亞克隆系統(tǒng)發(fā)育結(jié)構(gòu)”的文章彰顯GS FLX系統(tǒng)能精確鑒別出疾病相關(guān)區(qū)域的遺傳變異，以及鑒定出癌癥樣品中的低豐度體細胞突變。第一項研究是由美國國立癌癥研究院完成的。研究人員利用經(jīng)典鳥槍法對目標基因組區(qū)域進行測序，從而鑒別出與癌癥相關(guān)的雜合體變異。第二項研究中，英國Wellcome TrustSanger研究院利用454超深度擴增子測序，來檢測新且罕見的變異，包括多種B細胞慢性淋巴細胞白血病樣品抗體重鏈區(qū)的單核苷酸多態(tài)性（SNP）、插入和缺失。這些研究以及其他的研究論文可以在羅氏454網(wǎng)站（ ）上找到。
454測序系統(tǒng)除了為多項研究領(lǐng)域開辟了基因組分析之路，同時也加速了探索的步伐。研究、分析、撰寫并提交論文，經(jīng)同行評議后發(fā)表，按照傳統(tǒng)技術(shù)通常來說需要一年左右的時間。而利用Genome Sequencer系統(tǒng)發(fā)表研究成果的速度，顯然表明454測序結(jié)果的數(shù)據(jù)質(zhì)量高，且分析簡單。
454生命科學(xué)的總裁兼CEO Christopher Mcleod解釋到：“如此迅速達到250篇同行評議的發(fā)表論文，說明研究人員能輕松闡釋454的序列數(shù)據(jù)，并作出生物學(xué)上有意義的結(jié)論。454生命科學(xué)高質(zhì)量的超長讀長與易用的分析工具相結(jié)合，讓我們的客戶能更集中精力于科學(xué)，而不是技術(shù)。因而項目能快速完成，接著踏上新的研究道路。”
454 生命科學(xué)是羅氏應(yīng)用科學(xué)旗下卓越的中心之一，開發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測序系統(tǒng)，用于超高通量的DNA 測序。具體的應(yīng)用包括基因組的從頭測序和重測序、宏基因組學(xué)、RNA 分析和DNA 目標區(qū)域的定向測序。454 測序系統(tǒng)的特點是樣品制備簡單且無偏向性，讀長包括配對末端讀長超長且準確度高。454 測序系統(tǒng)的技術(shù)已經(jīng)催生了各個研究領(lǐng)域的幾百項經(jīng)同行評議的研究，例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋
生物學(xué)、人類學(xué)、古生物學(xué)等多個方面。更多信息，請查看http:///。
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