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1094 次 全基因組ChIP-seq分析揭示細(xì)菌轉(zhuǎn)錄因子PhoB的基因內(nèi)結(jié)合位點(diǎn) 2023-5-30
細(xì)菌編碼許多轉(zhuǎn)錄因子（transcription factor，TF），這些轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)與啟動(dòng)子周?chē)腄NA結(jié)合并調(diào)控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結(jié)合啟動(dòng)子DNA或異構(gòu)化為主動(dòng)轉(zhuǎn)錄構(gòu)象的能力來(lái)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始。目前對(duì)T
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1014 次 ChIP-seq等揭示熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b調(diào)控植物高溫脅迫響應(yīng)的分子機(jī)制 2023-4-24
在擬南芥中，熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通過(guò)影響種子產(chǎn)量來(lái)調(diào)控對(duì)環(huán)境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應(yīng)性的決定性因素，這種調(diào)控機(jī)制怎么形成的呢？2018年，
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1016 次 高通量測(cè)序后的下游實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證方法之ChIP-seq介紹 2023-3-28
此前，我們分享了染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序(ChIP-seq）的數(shù)據(jù)挖掘思路，進(jìn)而篩選出TF結(jié)合/組蛋白修飾的目標(biāo)區(qū)域和候選靶基因。做完ChIP-seq測(cè)序后，如果需要對(duì)分析結(jié)果中感興趣的內(nèi)容進(jìn)行后期驗(yàn)證，
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1333 次 染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序(ChIP-seq）的數(shù)據(jù)挖掘思路 2023-3-27
CHIP-seq研究的數(shù)據(jù)挖掘思路主要分為3步：1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征：peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點(diǎn)的距離分
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1086 次 ChIP-seq(組蛋白)揭示H3K36me修飾影響溫度誘導(dǎo)的植物可變剪接和開(kāi)花 2023-2-22
2017年，荷蘭瓦格寧根大學(xué)分子實(shí)驗(yàn)室RGH Immink團(tuán)隊(duì)以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”在《Genome
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4502 次 定量分析ChIP-qPCR數(shù)據(jù)的方法：Percent Input法和富集倍數(shù)法步驟介紹 2023-2-22
ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對(duì)可變性來(lái)源進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化，包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率（富集效率）和 DNA 回收率。兩種常用的標(biāo)準(zhǔn)化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法（F
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1155 次 染色質(zhì)免疫共沉淀ChIP實(shí)驗(yàn)的詳細(xì)實(shí)驗(yàn)步驟 2023-2-10
染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)，是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的經(jīng)典方法。開(kāi)始 ChIP 之前要考慮三件事（1）為您的實(shí)驗(yàn)查找適合的抗體（2）優(yōu)化染色質(zhì)剪切（3）評(píng)估您
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2789 次 ChipCytometry在深度挖掘FFPE石蠟組織切片空間蛋白組學(xué)信息的應(yīng)用 2022-1-4
組織微環(huán)境的深度剖析對(duì)于理解疾病生物學(xué)機(jī)制及進(jìn)展至關(guān)重要。在前面一期分享中，ChipCytometry技術(shù)的生物標(biāo)志物空間剖析與數(shù)據(jù)分析能力完美結(jié)合讓大家印象深刻（Chipcytometry：讓生物標(biāo)志物分
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6326 次 微環(huán)境多靶標(biāo)蛋白分析系統(tǒng)在細(xì)胞組織水平、分子機(jī)理等多領(lǐng)域的應(yīng)用 2021-5-11
Chipcytometry 微環(huán)境多靶標(biāo)蛋白分析系統(tǒng)是一種高質(zhì)量的多重生物標(biāo)志物成像分析技術(shù)，整合了創(chuàng)造性的樣品存儲(chǔ)技術(shù)、多重多通道檢測(cè)技術(shù)和基于圖像的單細(xì)胞分析方法，從根本上突破了傳統(tǒng)方法的各
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3289 次 揭秘神經(jīng)發(fā)育過(guò)程中m6A-RNA甲基化與組蛋白修飾間的關(guān)系 2020-10-20
文章導(dǎo)讀表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究在生物發(fā)育和疾病相關(guān)性等方面正越來(lái)越引起人們的關(guān)注。其中m6A修飾的研究是表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的一大熱點(diǎn)。研究表明，m6A標(biāo)簽在mRNA和lncRNA中超過(guò)10,000種，并且m6A參
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1781 次 去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應(yīng)用 2020-7-9
文章導(dǎo)讀表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發(fā)生和發(fā)展中起到重要作用。而甲基化酶對(duì)ai癥的影響也受到廣 泛關(guān)注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報(bào)道過(guò)能通過(guò)維持乳腺ai細(xì)胞的干細(xì)胞性而促進(jìn)腫 瘤的形
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324 次 DAP-seq技術(shù)助力胡楊耐鹽機(jī)制的研究 2020-4-21
2019年9月，北京林業(yè)大學(xué)和藍(lán)景科信合作，在植物學(xué)主流學(xué)術(shù)期刊Journal of Experimental Botany上（IF=5.36），發(fā)表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase
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5018 次 國(guó)自然研究熱點(diǎn)—eccDNA的前世今生 2020-3-18
1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？2019年11月，頂尖國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《Nature》和《Cell》相繼發(fā)表了關(guān)于染色體外環(huán)狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆
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1498 次 睪丸間質(zhì)細(xì)胞（LCs）m6A修飾提供新治療靶點(diǎn)在不育癥治療方向的應(yīng)用 2020-3-4
文章導(dǎo)讀m6A是真核生物中最常見(jiàn)的一類(lèi)RNA修飾，目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代謝和翻譯，以及在細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育和壓力應(yīng)答等過(guò)程中起重要作用。這一次，研究重大發(fā)現(xiàn)m6A修飾在“人類(lèi)
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3628 次 揭秘m6A修飾新功能 －－ 調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài)和轉(zhuǎn)錄活性 2020-1-20
文章導(dǎo)讀m6A是真核生物中最常見(jiàn)的一類(lèi)化學(xué)修飾，能夠在多種生物過(guò)程中發(fā)揮重要作用，包括癌癥發(fā)生發(fā)展、細(xì)胞分化、壓力應(yīng)答、免疫反應(yīng)以及神經(jīng)發(fā)育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對(duì)蛋白編碼
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2646 次 新型超微量染色質(zhì)免疫共沉淀ChIP-seq技術(shù)-Cut&Tag 2020-1-12
文章導(dǎo)讀染色質(zhì)免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation , ChIP）是研究蛋白質(zhì)與DNA互作的標(biāo)準(zhǔn)方法。通過(guò)與高通量測(cè)序技術(shù)相結(jié)合，研究者開(kāi)發(fā)了ChIP-seq技術(shù)，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白
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2297 次 植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒（CHIP）的使用 2019-10-15
蛋白質(zhì)和DNA的相互作用是調(diào)控細(xì)胞反應(yīng)過(guò)程的要素之一。染色質(zhì)免疫沉淀分析方法（chromatin immunoprecipitation, CHIP）是研究活體內(nèi)DNA和蛋白質(zhì)的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技術(shù)通過(guò)
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6193 次 Millipore試劑盒推薦使用Q800R3設(shè)備剪切染色質(zhì) 2019-6-11
染色質(zhì)通常被認(rèn)為是由DNA、組蛋白和非組蛋白組成的復(fù)合體。RNA染色質(zhì)復(fù)合體的成分被認(rèn)為是由mRNA或傳統(tǒng)的snRNA組成，它在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中短暫地與染色質(zhì)相關(guān)聯(lián)。然而，越來(lái)越多的證據(jù)表明各種類(lèi)型的非
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4498 次 看這里！miRNA怎樣蹭上m6A熱點(diǎn)發(fā)高分？ 2019-5-27
文章導(dǎo)讀胰腺癌是一種惡性程度很高，診斷和治療都很困難的消化道惡性腫瘤，約90%為起源于腺管上皮的導(dǎo)管腺癌。其發(fā)病率和死亡率近年來(lái)明顯上升。5年生存率<1%，是預(yù)后最差的惡性腫瘤之一。m6
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5093 次 Nature Cell Biology：外泌體LncRNA幫助免疫細(xì)胞“叛變”----乳腺癌惡化新機(jī)制！ 2019-4-26
文章導(dǎo)讀：外泌體是細(xì)胞間傳遞信號(hào)的媒介，直徑在30-200nm，表面具有磷脂雙分子層，內(nèi)部具有豐富內(nèi)含物的小囊泡，其內(nèi)含物包括miRNA，環(huán)狀RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前發(fā)表于Nature Cell Biol
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