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1094 次 全基因組ChIP-seq分析揭示細菌轉錄因子PhoB的基因內結合位點 2023-5-30
細菌編碼許多轉錄因子（transcription factor，TF），這些轉錄因子通過與啟動子周圍的DNA結合并調控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結合啟動子DNA或異構化為主動轉錄構象的能力來調節轉錄起始。目前對T
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1014 次 ChIP-seq等揭示熱休克轉錄因子A1b調控植物高溫脅迫響應的分子機制 2023-4-24
在擬南芥中，熱休克轉錄因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通過影響種子產量來調控對環境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應性的決定性因素，這種調控機制怎么形成的呢？2018年，
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1016 次 高通量測序后的下游實驗驗證方法之ChIP-seq介紹 2023-3-28
此前，我們分享了染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq）的數據挖掘思路，進而篩選出TF結合/組蛋白修飾的目標區域和候選靶基因。做完ChIP-seq測序后，如果需要對分析結果中感興趣的內容進行后期驗證，
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1333 次 染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq）的數據挖掘思路 2023-3-27
CHIP-seq研究的數據挖掘思路主要分為3步：1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征：peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點的距離分
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1086 次 ChIP-seq(組蛋白)揭示H3K36me修飾影響溫度誘導的植物可變剪接和開花 2023-2-22
2017年，荷蘭瓦格寧根大學分子實驗室RGH Immink團隊以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”在《Genome
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4502 次 定量分析ChIP-qPCR數據的方法：Percent Input法和富集倍數法步驟介紹 2023-2-22
ChIP-qPCR 數據需要針對可變性來源進行標準化，包括染色質數量、免疫沉淀的效率（富集效率）和 DNA 回收率。兩種常用的標準化 ChIP-qPCR 數據方法——Percent Input法和富集倍數法（F
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1155 次 染色質免疫共沉淀ChIP實驗的詳細實驗步驟 2023-2-10
染色質免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)，是研究體內蛋白質與DNA相互作用的經典方法。開始 ChIP 之前要考慮三件事（1）為您的實驗查找適合的抗體（2）優化染色質剪切（3）評估您
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2789 次 ChipCytometry在深度挖掘FFPE石蠟組織切片空間蛋白組學信息的應用 2022-1-4
組織微環境的深度剖析對于理解疾病生物學機制及進展至關重要。在前面一期分享中，ChipCytometry技術的生物標志物空間剖析與數據分析能力完美結合讓大家印象深刻（Chipcytometry：讓生物標志物分
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6326 次 微環境多靶標蛋白分析系統在細胞組織水平、分子機理等多領域的應用 2021-5-11
Chipcytometry 微環境多靶標蛋白分析系統是一種高質量的多重生物標志物成像分析技術，整合了創造性的樣品存儲技術、多重多通道檢測技術和基于圖像的單細胞分析方法，從根本上突破了傳統方法的各
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3289 次 揭秘神經發育過程中m6A-RNA甲基化與組蛋白修飾間的關系 2020-10-20
文章導讀表觀轉錄組學的研究在生物發育和疾病相關性等方面正越來越引起人們的關注。其中m6A修飾的研究是表觀轉錄組學研究的一大熱點。研究表明，m6A標簽在mRNA和lncRNA中超過10,000種，并且m6A參
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1781 次 去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用 2020-7-9
文章導讀表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形
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324 次 DAP-seq技術助力胡楊耐鹽機制的研究 2020-4-21
2019年9月，北京林業大學和藍景科信合作，在植物學主流學術期刊Journal of Experimental Botany上（IF=5.36），發表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase
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5018 次 國自然研究熱點—eccDNA的前世今生 2020-3-18
1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆
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1498 次 睪丸間質細胞（LCs）m6A修飾提供新治療靶點在不育癥治療方向的應用 2020-3-4
文章導讀m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾，目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代謝和翻譯，以及在細胞分化、胚胎發育和壓力應答等過程中起重要作用。這一次，研究重大發現m6A修飾在“人類
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3628 次 揭秘m6A修飾新功能 －－ 調控染色質狀態和轉錄活性 2020-1-20
文章導讀m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼
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2646 次 新型超微量染色質免疫共沉淀ChIP-seq技術-Cut&Tag 2020-1-12
文章導讀染色質免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation , ChIP）是研究蛋白質與DNA互作的標準方法。通過與高通量測序技術相結合，研究者開發了ChIP-seq技術，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白
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2297 次 植物染色質免疫沉淀試劑盒（CHIP）的使用 2019-10-15
蛋白質和DNA的相互作用是調控細胞反應過程的要素之一。染色質免疫沉淀分析方法（chromatin immunoprecipitation, CHIP）是研究活體內DNA和蛋白質的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技術通過
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6193 次 Millipore試劑盒推薦使用Q800R3設備剪切染色質 2019-6-11
染色質通常被認為是由DNA、組蛋白和非組蛋白組成的復合體。RNA染色質復合體的成分被認為是由mRNA或傳統的snRNA組成，它在轉錄過程中短暫地與染色質相關聯。然而，越來越多的證據表明各種類型的非
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4498 次 看這里！miRNA怎樣蹭上m6A熱點發高分？ 2019-5-27
文章導讀胰腺癌是一種惡性程度很高，診斷和治療都很困難的消化道惡性腫瘤，約90%為起源于腺管上皮的導管腺癌。其發病率和死亡率近年來明顯上升。5年生存率<1%，是預后最差的惡性腫瘤之一。m6
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5093 次 Nature Cell Biology：外泌體LncRNA幫助免疫細胞“叛變”----乳腺癌惡化新機制！ 2019-4-26
文章導讀：外泌體是細胞間傳遞信號的媒介，直徑在30-200nm，表面具有磷脂雙分子層，內部具有豐富內含物的小囊泡，其內含物包括miRNA，環狀RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前發表于Nature Cell Biol
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