上海南方基因科技有限公司成立于2000年8月，公司由上海生物芯片有限公司和國家人類基因組南方研究中心共同出資組建而成。

上海南方基因科技有限公司位于上海浦東張江高科技園區(qū)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地，總投資2355萬元人民幣。公司團(tuán)隊由具有豐富基因組研究經(jīng)歷和平臺技術(shù)研發(fā)和管理及經(jīng)營經(jīng)驗的人員組成。

公司已加入上海研發(fā)公共服務(wù)平臺共享網(wǎng)絡(luò)，為國內(nèi)外的生物醫(yī)藥行業(yè)科研單位、醫(yī)學(xué)院校和醫(yī)藥企業(yè)以及歐美的大型制藥公司提供了基因測序、STR全掃、SNP發(fā)掘、SNP分型和關(guān)聯(lián)分析、mRNA表達(dá)譜、甲基化水平檢測等技術(shù)服務(wù)，客戶包括：GSK、Lilly、Merck、Prifer、強(qiáng)生等國際大型制藥公司，平臺每年完成近1萬例樣本的檢測實驗和技術(shù)服務(wù)。另外，公司還承接了國家863計劃、973項目和全國各高校研究院所的大量科技攻關(guān)項目的技術(shù)服務(wù)，建立了GLP（GoodLaboratoryPractice）管理體系。目前公司每年累積服務(wù)量在1200機(jī)時以上，用戶在20家以上。