伴隨著 2019 年 SARS-CoV-2 的爆發，快速、高通量地識別和檢測病毒的高通量測序技術迅速成為幫助了解病毒傳播地點和傳播速度的必備手段。病毒測序對于檢測以及追蹤、監測和識別新變異必不可少。二代測序 (NGS)已擁有多種成熟的應用方案，而質量控制步驟對于確定起始核酸和文庫的完整性、分子量和濃度至關重要，可以保障成功的實驗與可靠的測序結果。在本白皮書中，我們通過對各類文獻的檢索，整理并展示了安捷倫自動化電泳系統是如何集成到從低通量到高通量的病毒測序 NGS 工作流程中，幫助實現高效、穩定的樣品質量控制 (QC)。
   
通過本書，您將了解到：

• 如何評估病毒 RNA 提取流程
• 病毒 DNA 或 cDNA 的質量控制
• 片段化和文庫構建的質量控制
• 病毒變異檢測的質量控制
• 病毒檢測中的質量控制

 
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目前，科學家已開發出多種測序方法，可以檢測復雜生物樣本中的已知病毒和新型病毒。測序數據的可靠性和質量很大程度上取決于起始材料的完整性和文庫制備過程。病毒基因組由單鏈或雙鏈 RNA或 DNA 組成，其大小和組成可能千差萬別。通常，病毒核酸與宿主基因組一起提取，其中病毒成分的含量相對較低。由于病毒和宿主基因組非常不同，很有必要優化從宿主核酸中提取病毒核酸以及單獨擴增病毒基因組的方案。
 
一般而言，對各種來源的起始 DNA 和RNA 進行質量控制 (QC)，有助于確定哪些樣本適合測序。其中包括檢查起始核酸的完整性、分子量和濃度。現有的各種提取方法和試劑盒會在所提取核酸的分子量、分布和濃度方面引入較大的變異性。因此，用于二代測序分析的核酸起始材料的完整性可能存在很大的差異。例如，來源于福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織和舊材料的樣品往往因化學固定、存放時間、溫度升高或紫外線輻射而降解。并且， RNA 和 DNA 還容易因酶解和處理不當而降解。此外，生物樣本的收集、處理、儲存和運輸等分析前流程會影響核酸的完整性。如果樣本產生明顯降解，僅存在小片段，則會導致測序數據不佳、目標編碼區域丟失以及全長RNA 和 gDNA 序列出現缺口。處理過程和環境影響永遠無法得到完全控制，并且影響樣本質量的因素非常多，因此非常有必要監測起始材料的質量。

安捷倫提供一系列自動化電泳儀器，包括生物分析儀、片段分析儀和 TapeStation系統，它們均是核酸質量控制的理想選擇。樣本檢測的結果會自動顯示在數字化膠圖、電泳圖以及包含分子量、濃度和摩爾濃度信息的表格中。每臺儀器僅需 1–2 µL 樣品即可進行分析，可以節省原始核酸樣本以用于病毒測序分析。儀器具有高靈敏度，可以檢測極低濃度的樣品。無論是低通量還是高通量實驗室，安捷倫全系列自動化電泳儀器總能滿足您的需求。