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463 次 cfWGBS揭示與年齡和肌萎縮側(cè)索硬化相關(guān)cfDNA甲基化變化及組織 2025-2-27
游離細胞DNA (Cell-free DNA，cfDNA)是血漿中游離的DNA片段，通常來源于正常細胞更新或病理狀態(tài)下的細胞死亡。cfDNA已被廣泛應(yīng)用于癌癥早期檢測、胎兒遺傳病診斷、器官移植評估等領(lǐng)域。然而，cf
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959 次 DAP-seq技術(shù)助力揭示水稻氮素吸收直接途徑和菌根途徑的新機制 2025-2-24
2025年2月18日，南京農(nóng)業(yè)大學徐國華、陳愛群教授團隊在PNAS期刊(IF=9.4)上發(fā)表了題為“OsNLP3 and OsPHR2 orchestrate direct and mycorrhizal pathways for nitrate uptake by regulating
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714 次 DAP-seq助力揭示蘋果轉(zhuǎn)錄因子MYB54調(diào)節(jié)細胞壁防御機制 2025-1-15
2024年12月11日，西北農(nóng)林科技大學馬鋒旺-李超團隊在The Plant Journal期刊（IF=6.2）發(fā)表了題為“MdMYB54 reduces disease severity caused by Fusarium solani in apple by modulating c
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124 次 picoMeRIP-seq技術(shù)揭示m6A修飾在小鼠發(fā)育早期的重要作用 2025-1-8
N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物中RNA最常見的內(nèi)部修飾，在多種生物過程，如RNA穩(wěn)定性、剪接、轉(zhuǎn)運和翻譯中發(fā)揮關(guān)鍵調(diào)控作用。但檢測所需大量的RNA阻礙了哺乳動物早期胚胎中的m6A分析。本研究通過
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555 次 時空組學研究進展（二)：單細胞RNA測序數(shù)據(jù)的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0scRNA-seq 的原始數(shù)據(jù)格式和目前大多數(shù)scRNA-seq 分析過程都基于 FASTQ 文件（或壓縮格式 fq.gz）。Illumina 平臺測序數(shù)據(jù)默認生成 BCL 格式文件
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975 次 時空組學研究進展（一）：單細胞RNA測序的流程與技術(shù) 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0單細胞測序概述單細胞測序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一種開創(chuàng)性的單細胞測序技術(shù)，現(xiàn)在已得到廣泛普及，并涵蓋了多種方法。盡
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860 次 DAP-seq助力揭示SmHSFA8調(diào)控茄子耐熱性機制 2024-12-23
2024年12月17日，華南農(nóng)業(yè)大學園藝學院曹必好教授團隊在Plant, Cell & Environment（中科院一區(qū)Top期刊，影響因子7.6）在線發(fā)表了題為SmHSFA8 enhances the heat tolerance of eggplant by
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792 次 基因沙漠：調(diào)控Shox2基因多效性表達與胚胎發(fā)育的關(guān)鍵區(qū)域 2024-11-20
文章題目：A gene desert required for regulatory control of pleiotropic Shox2 expression and embryonic survival發(fā)表時間：2024.10.10發(fā)表平臺：Nature Communications影響因子：IF 14.7 Q
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1011 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調(diào)控新機制 2024-10-23
2024年10月2日，云南農(nóng)業(yè)大學園林園藝學院營養(yǎng)逆境與品質(zhì)改良楊建立/范偉團隊在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在線發(fā)表題為“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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889 次 RNA Pull Down和RIP的技術(shù)應(yīng)用 2024-10-15
RNA Pull Down和RIP的技術(shù)應(yīng)用：ELF18誘導的lncRNA ELENA1與MED19a互作增強擬南芥免疫反應(yīng)植物和動物在自然環(huán)境中都面臨著被各種微生物感染的風險。與動物一樣，植物也演化出了一套模式識別受體
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926 次 Sfrp1抑制肺成纖維細胞向損傷誘導的肌成纖維細胞轉(zhuǎn)變期間的侵襲 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影響因子：16.6主要技術(shù)：scRNA-seq；空間轉(zhuǎn)錄組；成纖維細胞導語組織纖維化是大多數(shù)主要慢性疾病中最大的未解決的臨床問題之一，產(chǎn)生細胞外基質(zhì)（ECM）的肌
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1189 次 蛋白質(zhì)與RNA互作研究新技術(shù)：RNA親和純化測序（RAP-seq） 2024-10-10
蛋白質(zhì)和RNA是具有緊密關(guān)系的生物分子，能夠通過物理相互作用參與完成細胞的周期并調(diào)控細胞的生物學過程。如果干擾了它們的正常相互作用，將會導致細胞功能障礙和疾病發(fā)生。因此，研究RNA與蛋白
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829 次 DAP-seq助力揭示GhSBI1調(diào)控棉花果枝節(jié)間伸長的分子機制 2024-10-9
2024年7月26日，中國農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所張永山研究員團隊在Plant Biotechnology Journal（影響因子10.1）雜志上發(fā)表了題為“GhSBI1, a CUP-SHAPED COTYLEDON 2 homologue, modulates bra
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856 次 利用染色質(zhì)免疫共沉淀測序技術(shù)ChIP-seq等揭示頭頸鱗癌免疫逃逸機制 2024-10-9
免疫逃逸是癌癥進展的關(guān)鍵里程碑，是腫瘤免疫治療的理論基礎(chǔ)。頭頸部鱗狀細胞癌（(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)）是全球最常見的惡性腫瘤之一，傳統(tǒng)治療選擇包括手術(shù)切除、放
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1131 次 ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1軸在疾病進展中的表觀調(diào)控作用 2024-8-27
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領(lǐng)跑多組學科研服務(wù)的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一種慢性肝臟疾病，其特征是肝臟中脂肪積累、炎癥和纖維化。干擾
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922 次 植物組學時代的DNA甲基化研究在群體表觀遺傳學中的應(yīng)用 2024-8-20
DNA甲基化在許多生物過程中發(fā)揮著重要作用。得益于數(shù)十年來對DNA甲基化突變體的研究，如今對DNA甲基化的建立和維持機制有了很好的理解，尤其在擬南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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2173 次 微生物遺傳研究利器Tn-Seq轉(zhuǎn)座子測序技術(shù)的介紹與技術(shù)流程 2024-7-8
轉(zhuǎn)座子測序簡介轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn)是存在于染色體DNA上可自主復制和位移的基本單位，在細菌的染色體、質(zhì)粒或噬菌體之間可以自行移動，通過切割、整合等過程從基因組的一個位置“跳躍&rd
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789 次 DAP-seq技術(shù)助力揭示MdWRKY75調(diào)控蘋果耐熱性的分子機制 2024-7-4
2024年6月12日，西北農(nóng)林科技大學作物抗逆與高效生產(chǎn)全國重點實驗室/園藝學院蘋果抗逆與品質(zhì)改良創(chuàng)新團隊馬鋒旺教授/李超課題組在植物學知名期刊The Plant Cell（影響因子10）在線發(fā)表了題為&ld
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1103 次 seq-DAP-seq和ChIP-seq聯(lián)合檢測揭示花發(fā)育器官轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控機制 2024-6-28
技術(shù)簡介MADS轉(zhuǎn)錄因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是調(diào)控擬南芥花發(fā)育分化的重要DNA結(jié)合蛋白。在雌蕊發(fā)育階段，SEP3和AG形成異源四聚體，通過識別CArG-box序列來調(diào)控基因的表達。
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666 次 Ribo-seq與RNA-seq聯(lián)合分析揭示uAUG-ds翻譯調(diào)控機制 2024-6-25
技術(shù)簡介RNA-seq主要從轉(zhuǎn)錄組水平分析基因的表達調(diào)控機制，檢測用于核糖體翻譯的RNA序列及二級結(jié)構(gòu)。Ribo-seq主要用于檢測核糖體翻譯的起始位置、翻譯富集區(qū)和翻譯終止位置。RNA-seq與Ribo-seq聯(lián)
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