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  • 1016 ChIP-seq等揭示熱休克轉錄因子A1b調控植物高溫脅迫響應的分子機制 2023-4-24
    在擬南芥中,熱休克轉錄因子A1b(HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b,HSFA1b)通過影響種子產量來調控對環境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應性的決定性因素,這種調控機制怎么形成的呢?2018年,

  • 1020 高通量測序后的下游實驗驗證方法之ChIP-seq介紹 2023-3-28
    此前,我們分享了染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq)的數據挖掘思路,進而篩選出TF結合/組蛋白修飾的目標區域和候選靶基因。做完ChIP-seq測序后,如果需要對分析結果中感興趣的內容進行后期驗證,

  • 1338 染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq)的數據挖掘思路 2023-3-27
    CHIP-seq研究的數據挖掘思路主要分為3步:1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征:peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點的距離分

  • 324 次 DAP-seq技術助力胡楊耐鹽機制的研究 2020-4-21
    2019年9月,北京林業大學和藍景科信合作,在植物學主流學術期刊Journal of Experimental Botany上(IF=5.36),發表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase

  • 5019 國自然研究熱點—eccDNA的前世今生 2020-3-18
    ​1. eccDNA為什么火?它到底是何方神圣?2019年11月,頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,徹底顛覆

  • 3630 揭秘m6A修飾新功能 -- 調控染色質狀態和轉錄活性 2020-1-20
    文章導讀m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼

  • 2648 新型超微量染色質免疫共沉淀ChIP-seq技術-Cut&Tag 2020-1-12
    文章導讀染色質免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation , ChIP)是研究蛋白質與DNA互作的標準方法。通過與高通量測序技術相結合,研究者開發了ChIP-seq技術,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白

  • 5559 circRNA再發IF=18.88高分文章--circRNA機制研究匯總 2019-4-18
    circRNA再發IF=18.88高分文章--您想知道的circRNA機制研究,都在這兒……文章導讀超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調

  • 4101 ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的藥物聯用實驗中的應用 2018-2-28
    上海交通大學附屬瑞金醫院血液研究所趙維蒞教授團隊針對外周淋巴瘤的研究。近期,該課題組應用ChIP-seq聯合分析揭示了聯用西達本胺和地西他濱對組蛋白修飾基因突變的外周淋巴瘤的作用機制。該研

  • 2140 探究轉錄因子對于hESC代謝調控新機制研究 2016-12-26
    ESC在體外可無限自我更新和分化為機體內任何種類的細胞,在器官再生和細胞替代治療中具有廣闊的應用前景。然而,hESC維持自我更新及發育多能性的分子調控機制還有很多問題尚不清楚,妨礙了將其分

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